RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589469.5

PSME3-209, Transcript of proteasome activator subunit 3, human

TSL 3

Gene PSME3, Length 733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TINAG	Q9UJW2	476 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	LRRK2	Q5S007	2527 aa		18.43	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PLOD2	O00469	737 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PRRG2	O14669	202 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZNHIT1	O43257	154 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ABCB1	P08183	1280 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	HPCAL1	P37235	193 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PSPH	P78330	225 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	LIX1	Q8N485	282 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TLCD1	Q96CP7	247 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF597	Q96LX8	424 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	C1orf50	Q9BV19	199 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	NKIRAS1	Q9NYS0	192 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	POLE	Q07864	2286 aa		18.42	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469		A1L4Q6	167 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	LRRC3C	A6NJW4	275 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZG16	O60844	167 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SNX4	O95219	450 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	IFI6	P09912	130 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PRPS2	P11908	318 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	GP1BB	P13224	206 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	GPC1	P35052	558 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SLC18A1	P54219	525 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CORO7	P57737	925 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	HSPB3	Q12988	150 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF385B	Q569K4	471 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM198	Q66K66	360 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	BICRAL	Q6AI39	1079 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	OR2L13	Q8N349	312 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	MGARP	Q8TDB4	240 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TMBIM1	Q969X1	311 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CIDEC	Q96AQ7	238 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ELP4	Q96EB1	424 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	RILP	Q96NA2	401 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SORT1	Q99523	831 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	EIF3L	Q9Y262	564 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	UPK1A	O00322	258 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TRIM3	O75382	744 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	IGHG3	P01860	377 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	TPO	P07202	933 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CT45A8	P0DMV1	189 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CT45A9	P0DMV2	189 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	KRT20	P35900	424 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CASP3	P42574	277 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	BST1	Q10588	318 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SLC10A1	Q14973	349 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	IL23R	Q5VWK5	629 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	PACS2	Q86VP3	889 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	SLC44A2	Q8IWA5	706 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	HGD	Q93099	445 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	CCDC120	Q96HB5	630 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	HAO1	Q9UJM8	370 aa		18.4	■□□□□ 0.54
PSME3-209	ENST00000589469	ABCB7	O75027	752 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	UGT2B11	O75310	529 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	REM1	O75628	298 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	PSMG1	O95456	288 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MASP1	P48740	699 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	PTGR1	Q14914	329 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	SMU1	Q2TAY7	513 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	CD163	Q86VB7	1156 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	EID3	Q8N140	333 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	COL21A1	Q96P44	957 aa		18.39	■□□□□ 0.53
PSME3-209	ENST00000589469	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	18.39	■□□□□ 0.53

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