RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 FAPQ12884 760 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 SLAMF1Q13291 335 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 MINDY4Q4G0A6 757 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 OR4C11Q6IEV9 310 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GPR26Q8NDV2 337 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 OR5J2Q8NH18 312 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 THAP4Q8WY91 577 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 IGSF21Q96ID5 467 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CORINQ9Y5Q5 1042 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CITO14578 2027 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 HYKKA2RU49 373 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 HHLA1C9JL84 531 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PCDHGA12O60330 932 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 C1QAP02745 245 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 AHCYP23526 432 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 CXCR1P25024 350 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 TACR1P25103 407 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 MAN2A2P49641 1150 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GPR143P51810 404 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ACTBP60709 375 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ACTG1P63261 375 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PDGFRLQ15198 375 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 PGBD5Q8N414 524 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 RIT1Q92963 219 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 GAL3ST1Q99999 423 aa9.84□□□□□ -0.83
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PTPRM-205ENST00000577827 KCNK12Q9HB15 430 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRM-205ENST00000577827 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 M0R129 80 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 PRKCZQ05513 592 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ARFRP1Q13795 201 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 JAGN1Q8N5M9 183 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 SOCS7O14512 581 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 HPGDSO60760 199 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 SPATC1Q76KD6 591 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 SC5DO75845 299 aa9.83□□□□□ -0.84
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PTPRM-205ENST00000577827 ACTR1BP42025 376 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ACTR1AP61163 376 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 ERVK-21P61565 698 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 MPP7Q5T2T1 576 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRM-205ENST00000577827 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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