RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575783.5

CTDNEP1-211, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 876 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-211ENST00000575783 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.64□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLOCKO15516 846 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PEPDP12955 493 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DPP4P27487 766 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SERPINB1P30740 379 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 XKP51811 444 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLDN15P56746 228 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CYP1B1Q16678 543 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NTMT1Q9BV86 223 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ITPAQ9BY32 194 aa14.63□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SEC14L5O43304 696 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TNFRSF21O75509 655 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GBAP04062 536 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DANCRP0C864 163 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 S1PR1P21453 382 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PON3Q15166 354 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 EXT2Q93063 718 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FBXW5Q969U6 566 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMCO6Q96DC7 493 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CD244Q9BZW8 370 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DERL2Q9GZP9 239 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.075e-8■□□□□ 9.7
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A0A6YYD5 115 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SSX4O60224 188 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 REM1O75628 298 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 BSGP35613 385 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 SLC12A2P55011 1212 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4D1Q15615 310 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CDKL4Q5MAI5 379 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM111BQ6SJ93 734 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 NEUROG1Q92886 237 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 COL21A1Q96P44 957 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CFL2Q9Y281 166 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CR1P17927 2039 aa14.61□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 A0A1W2PP18 115 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 FAM234BA2RU67 622 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ACOX3O15254 700 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CCDC166P0CW27 439 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ELK3P41970 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PIK3CBP42338 1070 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 E2F2Q14209 437 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 RAET1LQ5VY80 246 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR4K17Q8NGC6 315 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 OR5M1Q8NGP8 315 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TMBIM1Q969X1 311 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF337Q9Y3M9 751 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 ZNF175Q9Y473 711 aa14.6□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 C17orf51A8MQB3 221 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 AQP8O94778 261 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CPMP14384 443 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 PORP16435 677 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 GRK2P25098 689 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CASP9P55211 416 aa14.59□□□□□ -0.07
CTDNEP1-211ENST00000575783 CLDN20P56880 219 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms