RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	SLCO2B1	O94956	709 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM16	O95361	564 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SOD1	P00441	154 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	RPN2	P04844	631 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST1H2AG	P0C0S8	130 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CHRNB1	P11230	501 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GFAP	P14136	432 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	IL9	P15248	144 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CYP2A7	P20853	494 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CFP	P27918	469 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CHAT	P28329	748 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIM23	P36406	574 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	HNMT	P50135	292 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	METAP1	P53582	386 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA1024L	P59773	190 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SIRPA	P78324	504 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SEMG2	Q02383	582 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	KRT33B	Q14525	404 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ZSCAN26	Q16670	478 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MEP1B	Q16820	701 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SGO1	Q5FBB7	561 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	EFL1	Q7Z2Z2	1120 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GPSM1	Q86YR5	675 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	FBXO39	Q8N4B4	442 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	HM13	Q8TCT9	377 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ATL1	Q8WXF7	558 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ELMO1	Q92556	727 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM159	Q96B96	161 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	DACH2	Q96NX9	599 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CCT7	Q99832	543 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MLST8	Q9BVC4	326 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SZT2	Q5T011	3432 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	C5orf42	Q9H799	3197 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139		A4D1N5	150 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	IGLON5	A6NGN9	336 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SHISA7	A6NL88	538 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	FPGT	O14772	594 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CHUK	O15111	745 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	KMO	O15229	486 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SUPT3H	O75486	399 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC22A3	O75751	556 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	KIAA0754	O94854	1291 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ANXA5	P08758	320 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	GABRG2	P18507	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CCR7	P32248	378 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	PCGF2	P35227	344 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	MPL	P40238	635 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TPMT	P51580	245 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	NAGLU	P54802	743 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	YPEL5	P62699	121 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	IRX4	P78413	519 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CDK3	Q00526	305 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	LCP2	Q13094	533 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TGFBI	Q15582	683 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	OR4D1	Q15615	310 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF124	Q15973	351 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	TMEM198	Q66K66	360 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SBSN	Q6UWP8	590 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC22A15	Q8IZD6	547 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT1-222	ENST00000570139	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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