RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	FOXM1	Q08050	763 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	GAGE5	Q13069	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	GAGE6	Q13070	117 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	BIRC2	Q13490	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	NFE2L1	Q14494	772 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	KIR2DS5	Q14953	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TAZ	Q16635	292 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	VPS35	Q96QK1	796 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKMY1	Q9P2S6	941 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFHX3	Q15911	3703 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	OR2AG2	A6NM03	316 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CCL22	O00626	93 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	KMO	O15229	486 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UGT1A9	O60656	530 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	GUCY1B2	O75343	617 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SPAG6	O75602	509 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	H2AFZ	P0C0S5	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PAX1	P15863	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UGT1A6	P19224	532 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TCN2	P20062	427 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	AGA	P20933	346 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UGT1A1	P22309	533 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	UGT1A4	P22310	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CA4	P22748	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	BDKRB2	P30411	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CCR10	P46092	362 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	MLLT10	P55197	1068 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	DMPK	Q09013	629 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ABR	Q12979	859 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PEX6	Q13608	980 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	CHRNA6	Q15825	494 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	IRGC	Q6NXR0	463 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	H2AFV	Q71UI9	128 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	VSIG1	Q86XK7	387 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	VSTM4	Q8IW00	320 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC38A9	Q8NBW4	561 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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