RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GLOD5A6NK44 160 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TGFB1P01137 390 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 AHSGP02765 367 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SLC35E2BP0CK96 405 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SLC35E2P0CK97 266 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 KRT15P19012 456 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 EPORP19235 508 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 CASP2P42575 452 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 MAGEA6P43360 314 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TERF1P54274 439 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GAS1P54826 345 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 CDKL1Q00532 357 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 DOC2AQ14183 400 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 AP5B1Q2VPB7 878 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 OR4C11Q6IEV9 310 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 BEND4Q6ZU67 534 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 PEX26Q7Z412 305 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GPR180Q86V85 440 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ZNF619Q8N2I2 560 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 METTL25Q8N6Q8 603 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 UBL4BQ8N7F7 174 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 CALML6Q8TD86 181 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 RNF138Q8WVD3 245 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 HES6Q96HZ4 224 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SERPINB12Q96P63 405 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 MS4A12Q9NXJ0 267 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ARMCX1Q9P291 453 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 DKKL1Q9UK85 242 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ASB4Q9Y574 426 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 RYR3Q15413 4870 aa10.04□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 A0A1W2PR48 441 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 MAGEB16A2A368 324 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 EFCAB8A8MWE9 144 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TMPRSS2O15393 492 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TAPBPO15533 448 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SEC14L5O43304 696 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 DLX3O60479 287 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 LY6HO94772 140 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TGFAP01135 160 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 CCDC175P0C221 793 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 SSR2P43308 183 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 TMEM35AQ53FP2 167 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 FIGNL1Q6PIW4 674 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 C4orf22Q6V702 233 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GALNT12Q8IXK2 581 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 RNF175Q8N4F7 328 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 BANPQ8N9N5 519 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 OR5M1Q8NGP8 315 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 ITPAQ9BY32 194 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 EMC9Q9Y3B6 208 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 OARD1Q9Y530 152 aa10.03□□□□□ -0.8
CS-208ENST00000547298 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 PLPP1O14494 284 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 TMPRSS11DO60235 418 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 MBD3O95983 291 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 CCDC166P0CW27 439 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 MAGEA3P43357 314 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 HNMTP50135 292 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 NEK2P51955 445 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 IRF9Q00978 393 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 MGAT2Q10469 447 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 KIF5AQ12840 1032 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 E2F2Q14209 437 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 GGTLC2Q14390 218 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 SPA17Q15506 151 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 CCNG2Q16589 344 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 FBXO48Q5FWF7 155 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 DEPDC1Q5TB30 811 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 AGAP6Q5VW22 663 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 CNGA4Q8IV77 575 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 CCDC170Q8IYT3 715 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 KAT2AQ92830 837 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 SIGLEC10Q96LC7 697 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-208ENST00000547298 EGFL8Q99944 293 aa10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms