RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 FPR3P25089 353 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 GIPRP48546 466 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RORCP51449 518 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FUT5Q11128 374 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SSX1Q16384 188 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SNAPC1Q16533 368 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 DECR1Q16698 335 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LEXMQ3ZCV2 418 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 C2orf27AQ580R0 203 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SYT14P1Q58G82 188 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MANEAQ5SRI9 462 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FAM180BQ6P0A1 224 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ABHD13Q7L211 337 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SPRED2Q7Z698 418 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZER1Q7Z7L7 766 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PEX5LQ8IYB4 626 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FBXL6Q8N531 539 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 AMER3Q8N944 861 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CAMKVQ8NCB2 501 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR6T1Q8NGN1 323 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PMM1Q92871 262 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TMCO6Q96DC7 493 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RIPOR3Q96MK2 946 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF681Q96N22 645 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 WDFY2Q96P53 400 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KXD1Q9BQD3 176 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ARMC7Q9H6L4 198 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KCNK12Q9HB15 430 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 HHATLQ9HCP6 504 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FGF22Q9HCT0 170 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 DOLKQ9UPQ8 538 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TRAPPC4Q9Y296 219 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 SNX11Q9Y5W9 270 aa9.19□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PRR23AA6NEV1 266 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 K7EQS6 105 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBX1O43435 398 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CHST10O43529 356 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TNFSF14O43557 240 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 IL1AP01583 271 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TP53P04637 393 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LAMP2P13473 410 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CPEP16870 476 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CPN2P22792 545 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 GRK5P34947 590 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 FEN1P39748 380 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MC3RP41968 323 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 MAN2A2P49641 1150 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 WNT4P56705 351 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 YPEL5P62699 121 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 BTN3A2P78410 334 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 IFITM3Q01628 133 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CBX3Q13185 183 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 GPR19Q15760 415 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 CCDC190Q86UF4 302 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 NLGN4XQ8N0W4 816 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 PARP16Q8N5Y8 322 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 POC5Q8NA72 575 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 AP3S1Q92572 193 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 DIO2Q92813 273 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 KLK6Q92876 244 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 UFD1Q92890 307 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 LRR1Q96L50 414 aa9.18□□□□□ -0.94
CS-205ENST00000546891 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms