RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	GCK	P35557	465 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A8	P48029	635 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SNTA1	Q13424	505 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CYP1B1	Q16678	543 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MED27	Q6P2C8	311 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PINK1	Q9BXM7	581 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	DDX31	Q9H8H2	851 aa	Known RBP	10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF639	Q9UID6	485 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PROCR	Q9UNN8	238 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		10.89	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CDH16	O75309	829 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CBX7	O95931	251 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	KRT15	P19012	456 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	DPP4	P27487	766 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	BUD31	P41223	144 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ELK3	P41970	407 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	XK	P51811	444 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FAP	Q12884	760 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ETFDH	Q16134	617 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CTU2	Q2VPK5	515 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	STEAP4	Q687X5	459 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	RNF138	Q8WVD3	245 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	BEX2	Q9BXY8	128 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CD244	Q9BZW8	370 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	DERL2	Q9GZP9	239 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CHMP2B	Q9UQN3	213 aa		10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.88	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CPM	P14384	443 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CD1D	P15813	335 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	EPB42	P16452	691 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	NT5E	P21589	574 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	IVD	P26440	423 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	NEK2	P51955	445 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	RAP1GDS1	P52306	607 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PON3	Q15166	354 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SEZ6L2	Q6UXD5	910 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	TMBIM1	Q969X1	311 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	REPS1	Q96D71	796 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ACTR6	Q9GZN1	396 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	PLLP	Q9Y342	182 aa		10.87	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	FAM234B	A2RU67	622 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	CLOCK	O15516	846 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SEC14L5	O43304	696 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	SSX4	O60224	188 aa		10.86	□□□□□ -0.67
BBS1-222	ENST00000533557	NTN1	O95631	604 aa		10.86	□□□□□ -0.67

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