RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NRAP	Q86VF7	1730 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GAK	O14976	1311 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		3.12	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ATP10D	Q9P241	1426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MYH3	P11055	1940 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8IP	A6NC78	632 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TMEM114	B3SHH9	223 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NDC80	O14777	642 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KMO	O15229	486 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MT-ND2	P03891	347 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ADRB2	P07550	413 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MYBL1	P10243	752 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ANPEP	P15144	967 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CD9	P21926	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CPT2	P23786	658 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IL32	P24001	234 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TMOD1	P28289	359 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SERPINB6	P35237	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CAPZA2	P47755	286 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCNG1	P51959	295 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	VSNL1	P62760	191 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DPYS	Q14117	519 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GCKR	Q14397	625 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GRB14	Q14449	540 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	STK38	Q15208	465 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TAZ	Q16635	292 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ODF2	Q5BJF6	829 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IL23R	Q5VWK5	629 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FUT10	Q6P4F1	479 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RUFY3	Q7L099	469 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA24	Q86W54	205 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	APCDD1	Q8J025	514 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCDC185	Q8N715	623 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	RMDN1	Q96DB5	314 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CFAP57	Q96MR6	1250 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF558	Q96NG5	402 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MTMR9	Q96QG7	549 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DEPP	Q9NTK1	212 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GID8	Q9NWU2	228 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	USP16	Q9Y5T5	823 aa		3.11	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TJP1	Q07157	1748 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CASZ1	Q86V15	1759 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NUP98	P52948	1817 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SPEF2	Q9C093	1822 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GLI3	P10071	1580 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HIP1	O00291	1037 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	HAT1	O14929	419 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MLNR	O43193	412 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	STX6	O43752	255 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NMT2	O60551	498 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PFKFB2	O60825	505 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	PRAF2	O60831	178 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ATP9A	O75110	1047 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GMNN	O75496	209 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KRT75	O95678	551 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	FYN	P06241	537 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	TCF4	P15884	667 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	IFNA8	P32881	189 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	MATK	P42679	507 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	SLC1A4	P43007	532 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	B2M	P61769	119 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC3	Q13217	504 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	GNA13	Q14344	377 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CYTH1	Q15438	398 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF79	Q15937	498 aa		3.1	□□□□□ -1.91
COPS5-208	ENST00000519057	CAMK4	Q16566	473 aa		3.1	□□□□□ -1.91

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