RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 RDH12Q96NR8 316 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 SLC38A1Q9H2H9 487 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 LRRN3Q9H3W5 708 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 SMOC1Q9H4F8 434 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 EXD2Q9NVH0 621 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 TESMINQ9Y4I5 508 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ENPP4Q9Y6X5 453 aa24.33■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 AGR2O95994 175 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ACP2P11117 423 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MAP4K2Q12851 820 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 DUSP5Q16690 384 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 C16orf62Q7Z3J2 963 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CDS1Q92903 461 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF354BQ96LW1 612 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CXorf21Q9HAI6 301 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 NDOR1Q9UHB4 597 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 J3KTA2 159 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMDEC1O15204 470 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 JRKO75564 520 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 IFNW1P05000 195 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 OR1D4P47884 311 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 TMEM154Q6P9G4 183 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 OR4D9Q8NGE8 314 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 NDC1Q9BTX1 674 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CALML5Q9NZT1 146 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa24.32■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 HS6ST1O60243 411 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 DNAJB5O75953 348 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ALBP02768 609 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ANKRD34CP0C6C1 535 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MAOAP21397 527 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MAPK10P53779 464 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 HSD17B7P56937 341 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CHRNEQ04844 493 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 PROX2Q3B8N5 592 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 VWA5B2Q8N398 1253 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 FBXL20Q96IG2 436 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 DSPPQ9NZW4 1301 aa24.31■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 H0YAE9 185 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CBX7O95931 251 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CKMT1AP12532 417 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 S1PR1P21453 382 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MYF6P23409 242 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MYBPC1Q00872 1141 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 C17orf50Q8WW18 174 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 PIP5K1AQ99755 562 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 PIGUQ9H490 435 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 TOR3AQ9H497 397 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 A8MVJ9 347 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 PDX1P52945 283 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 HMGN2P46Q86SG4 172 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 COMTD1Q86VU5 262 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CYP4Z1Q86W10 505 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 GALNT12Q8IXK2 581 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 IFI44Q8TCB0 444 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 LANCL2Q9NS86 450 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 GALNT8Q9NY28 637 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 SCOCQ9UIL1 159 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ADAMTS20P59510 1910 aa24.3■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 VPS13AQ96RL7 3174 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 TNFRSF11BO00300 401 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CLIC3O95833 236 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ATXN8OSP0DMR3 200 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 RHCEP18577 417 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 DAPP51397 102 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 DUSP8Q13202 625 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MLIPQ5VWP3 458 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF605Q86T29 641 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 CDRT4Q8N9R6 151 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 OR4D11Q8NGI4 311 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 RIT1Q92963 219 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 ZG16BQ96DA0 208 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MBOAT4Q96T53 435 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 WFDC6Q9BQY6 131 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 FANCEQ9HB96 536 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 FCMRO60667 390 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 MAP3K8P41279 467 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 SPIBQ01892 262 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 USP51Q70EK9 711 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 OR52R1Q8NGF1 315 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 OR4C15Q8NGM1 316 aa24.29■■□□□ 1.48
HOXB3-212ENST00000498678 NECTIN3Q9NQS3 549 aa24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms