RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	NAGLU	P54802	743 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	IRF8	Q02556	426 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DMTN	Q08495	405 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAMF1	Q13291	335 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	LAPTM5	Q13571	262 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DOC2A	Q14183	400 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	MLANA	Q16655	118 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC27	Q6P3X3	843 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	BBOF1	Q8ND07	529 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD7	Q92527	254 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TANK	Q92844	425 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP36	Q96G28	342 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	UBQLN3	Q9H347	655 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EHD1	Q9H4M9	534 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		9.84	□□□□□ -0.83
SKAP2-209	ENST00000497511	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MXE2	369 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH16	O75309	829 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	BANF1	O75531	89 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLCO1A2	P46721	670 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA7	P48741	367 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC12A2	P55011	1212 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM27E3	Q08E93	113 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF460	Q14592	562 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PDK4	Q16654	411 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ANGPTL8	Q6UXH0	198 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT7	Q86SF2	657 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR180	Q86V85	440 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PHC2	Q8IXK0	858 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR22	Q8IZ63	422 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CNEP1R1	Q8N9A8	125 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RDH11	Q8TC12	318 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2E3	Q969T4	207 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP6	Q96JE9	813 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT9	Q9BTE0	207 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR41	Q9HAD4	459 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF11	Q9UIL8	331 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		9.83	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKRA	O75569	313 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	STK16	O75716	305 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	POU2F1	P14859	743 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CPN1	P15169	458 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CHM	P24386	653 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CD79B	P40259	229 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	MC3R	P41968	323 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CASP3	P42574	277 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	NR1H2	P55055	460 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP5J2	P56134	94 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC37A1	P57057	533 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TNFRSF17	Q02223	184 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CHIT1	Q13231	466 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R7	Q15435	360 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFBI	Q15582	683 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf63	Q68DL7	685 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM139	Q8IV31	216 aa		9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
SKAP2-209	ENST00000497511	ESAM	Q96AP7	390 aa		9.82	□□□□□ -0.84

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