RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LANCL1O43813 399 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TOXO94900 526 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F21O95013 312 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 IGSF6O95976 241 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 KRT8P05787 483 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RFC2P35250 354 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PTGFRP43088 359 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ATP4BP51164 291 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ACY1Q03154 408 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZP4Q12836 540 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OVGP1Q12889 678 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CD226Q15762 336 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 REP15Q6BDI9 236 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 NIPAL3Q6P499 406 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 DOK6Q6PKX4 331 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 METTL7BQ6UX53 244 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF562Q6V9R5 426 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TMUB2Q71RG4 321 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LPCAT2Q7L5N7 544 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CBWD2Q8IUF1 395 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HSCBQ8IWL3 235 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FADS6Q8N9I5 356 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OR10T2Q8NGX3 314 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OR52J3Q8NH60 311 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MIPOL1Q8TD10 442 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 THRSPQ92748 146 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF597Q96LX8 424 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VPS35Q96QK1 796 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VPS33BQ9H267 617 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FAM114A2Q9NRY5 505 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CENPMQ9NSP4 180 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EPM2AB3EWF7 344 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 H3BMH7 237 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 KRT13P13646 458 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 UQCRBP14927 111 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN8P19075 237 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 CENPUQ71F23 418 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 STKLD1Q8NE28 680 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VPS39Q96JC1 886 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 C18orf12Q96KH6 178 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PSMB7Q99436 277 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TSPY26PQ9H489 355 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ABCC13Q9NSE7 274 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PARD3Q8TEW0 1356 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 PCCBP05166 539 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GSTT2P0CG29 244 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 GSTT2BP0CG30 244 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HTR5AP47898 357 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 FCHO2Q0JRZ9 810 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ELP6Q0PNE2 266 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRIP10Q15642 601 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EMBQ6PCB8 327 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ERASQ7Z444 233 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ARL14Q8N4G2 192 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OR4F4Q96R69 305 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0J9YWU9 116 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 H0YL77 283 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 E2F3O00716 465 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 IMPA2O14732 288 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ANP32DO95626 131 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HOXB7P09629 217 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 SOX6P35712 828 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 OSTNP61366 133 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 VWA2Q5GFL6 755 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 SLC39A4Q6P5W5 647 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PTPRC-212ENST00000491302 HPDLQ96IR7 371 aa6.23□□□□□ -1.41
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