RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491274.5

SDHB-208, Transcript of succinate dehydrogenase complex iron sulfur subunit B, humanhuman

TSL 5

Gene SDHB, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHB-208ENST00000491274 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CFL2Q9Y281 166 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.16□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PCSK5Q92824 1860 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SCN3AQ9NY46 2000 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ANKRD12Q6UB98 2062 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TMEM114B3SHH9 223 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TMEM233B4DJY2 109 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 G3V3Y1 287 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ACOT7O00154 380 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TP53I11O14683 189 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PIP5K1BO14986 540 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 BIRC5O15392 142 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 LRRTM2O43300 516 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PEX11AO75192 247 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PDE9AO76083 593 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ATP1B1P05026 303 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SERPINE1P05121 402 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 FGF4P08620 206 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 DDCP20711 480 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CNR1P21554 472 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 GRK2P25098 689 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MST1P26927 711 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 NTSP30990 170 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PTGER1P34995 402 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 KRT20P35900 424 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 RFC3P40938 356 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MEOX1P50221 254 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PER3P56645 1201 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SLC37A1P57057 533 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 KCNJ2P63252 427 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 RPP38P78345 283 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 FUT7Q11130 342 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MAP4K2Q12851 820 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 STX3Q13277 289 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 LTB4RQ15722 352 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SLC22A10Q63ZE4 541 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 KANK2Q63ZY3 851 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PAOXQ6QHF9 649 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TMEM64Q6YI46 380 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ZBTB46Q86UZ6 589 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 C9orf40Q8IXQ3 194 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 FAM9CQ8IZT9 166 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SLC15A4Q8N697 577 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 POGLUT1Q8NBL1 392 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 OR52R1Q8NGF1 315 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MGARPQ8TDB4 240 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TWIST2Q8WVJ9 160 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 KAT2AQ92830 837 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TP53INP1Q96A56 240 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TUBGCP3Q96CW5 907 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MAGED4Q96JG8 741 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PPP3R2Q96LZ3 170 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CCT7Q99832 543 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 EHD3Q9NZN3 535 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 HEY2Q9UBP5 337 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PRODH2Q9UF12 536 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.15□□□□□ -1.42
SDHB-208ENST00000491274 MED13Q9UHV7 2174 aa6.15□□□□□ -1.43
SDHB-208ENST00000491274 NBASA2RRP1 2371 aa6.14□□□□□ -1.43
SDHB-208ENST00000491274 A0A1B0GUH1 482 aa6.14□□□□□ -1.43
SDHB-208ENST00000491274 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.14□□□□□ -1.43
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