RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476502.1

TRBV1-201, Transcript of T cell receptor beta variable 1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene TRBV1, Length 284 nt, Biotype TR V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV1-201ENST00000476502 SOX3P41225 446 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 BTDP43251 543 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 OR3A2P47893 321 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DNA2P51530 1060 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ARFIP1P53367 373 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 BEX3Q00994 111 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SLC3A1Q07837 685 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SCGB2A2Q13296 93 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 RAPSNQ13702 412 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GIT2Q14161 759 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 OPCMLQ14982 345 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC57Q2TAC2 916 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CAVIN4Q5BKX8 364 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ARMCX4Q5H9R4 360 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CES4AQ5XG92 561 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 KLHL10Q6JEL2 608 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SLC25A24Q6NUK1 477 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF613Q6PF04 617 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 RGS9BPQ6ZS82 235 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SYVN1Q86TM6 617 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 RCOR2Q8IZ40 523 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 OR7A2PQ8NGA2 310 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 FBXO30Q8TB52 745 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 MRGPRDQ8TDS7 321 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 UBTD2Q8WUN7 234 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 METTL21AQ8WXB1 218 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ARHGAP45Q92619 1136 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 THRSPQ92748 146 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SLCO4A1Q96BD0 722 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 C14orf79Q96F83 325 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 C2orf48Q96LS8 159 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GLT1D1Q96MS3 346 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TSPAN18Q96SJ8 248 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 KRT12Q99456 494 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 LPAR4Q99677 370 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DCTN5Q9BTE1 182 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 NTMT1Q9BV86 223 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 MTMR12Q9C0I1 747 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CCSER1Q9C0I3 900 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ATG10Q9H0Y0 220 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TRPV6Q9H1D0 765 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DPEP3Q9H4B8 488 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SLC7A10Q9NS82 523 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PILRBQ9UKJ0 227 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 WDR37Q9Y2I8 494 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 KIF3AQ9Y496 699 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 IKBKGQ9Y6K9 419 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 IL16Q14005 1332 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 LOC285556D6RIA3 1793 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.56□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 A0A0U1RRA0 63 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 MPTX1A8MV57 137 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 F8WDY8 70 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 H0YCG3 227 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GRIN2DO15399 1336 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ZZEF1O43149 2961 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 MBTPS2O43462 519 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GRAP2O75791 330 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ELP1O95163 1332 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 OR6A2O95222 327 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TPM2P07951 284 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PRG2P13727 222 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 AZU1P20160 251 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PKLRP30613 574 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 SRD5A2P31213 254 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 STIP1P31948 543 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 NEDD4P46934 1319 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 PAX9P55771 341 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 ELP6Q0PNE2 266 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 MYO7AQ13402 2215 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TRIM29Q14134 588 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 DOCK1Q14185 1865 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TRADDQ15628 312 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 STX1AQ16623 288 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 GON4LQ3T8J9 2241 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 CMPK2Q5EBM0 449 aa2.55□□□□□ -2
TRBV1-201ENST00000476502 TCEAL5Q5H9L2 206 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms