RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436638.5

ECHDC1-208, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ECHDC1, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR2A5	Q96R48	311 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	LMF1	Q96S06	567 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GP6	Q9HCN6	339 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	APMAP	Q9HDC9	416 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	STARD5	Q9NSY2	213 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CUTC	Q9NTM9	273 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRR13	Q9NZ81	148 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	AHSP	Q9NZD4	102 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	POLH	Q9Y253	713 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		5.82	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCM1	Q15154	2024 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A0A6YYJ9	748 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638		A0A1W2PPW3	197 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638		C9J4A7	227 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	DSCR3	O14972	297 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	AZIN1	O14977	448 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PGRMC2	O15173	223 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	NRP2	O60462	931 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PSPN	O60542	156 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	RAD1	O60671	282 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CYTIP	O60759	359 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTP4A3	O75365	173 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ULK1	O75385	1050 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	RBBP9	O75884	186 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	STK17B	O94768	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	STATH	P02808	62 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	NTRK1	P04629	796 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GSN	P06396	782 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CAPN1	P07384	714 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINA6	P08185	405 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GAA	P10253	952 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	UROS	P10746	265 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SELL	P14151	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CCNA2	P20248	432 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CD22	P20273	847 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	TNFSF4	P23510	183 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	RRM2	P31350	389 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC5A2	P31639	672 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PCGF2	P35227	344 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PIK3CB	P42338	1070 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	GABRA4	P48169	554 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PRIM2	P49643	509 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF33B	Q06732	778 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	TSC22D1	Q15714	1073 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	FRG2	Q64ET8	278 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SYVN1	Q86TM6	617 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	LAS2	Q8IYD9	372 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	CLYBL	Q8N0X4	340 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638		Q8NFD4	153 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	OR7G3	Q8NG95	312 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	NT5C	Q8TCD5	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	AGAP11	Q8TF27	550 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	MR1	Q95460	341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	FRG2B	Q96QU4	278 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SERPINI1	Q99574	410 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.81	□□□□□ -1.48
ECHDC1-208	ENST00000436638	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.81	□□□□□ -1.48

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