RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALG2Q9H553 416 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASB4Q9Y574 426 aa14.86□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PR48 441 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB8A8MWE9 144 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01387J3KSC0 135 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLOCKO15516 846 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZIC3O60481 467 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PGRP06401 933 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CD3EP07766 207 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CT62P0C5K7 136 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM58BPP0C7Q3 252 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPB42P16452 691 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PON3Q15166 354 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NNATQ16517 81 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP1B1Q16678 543 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP20A1Q6UW02 462 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BEND4Q6ZU67 534 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPIL6Q8IXY8 311 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESAMQ96AP7 390 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DESI2Q9BSY9 194 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NGBQ9NPG2 151 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WHRNQ9P202 907 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.85□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A096LNT2 108 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SSX4O60224 188 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PYGBP11216 843 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EPORP19235 508 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3CBP42338 1070 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B3GALT5-AS1P59052 145 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAPQ12884 760 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF460Q14592 562 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO48Q5FWF7 155 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPSM1Q86YR5 675 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTMT1Q9BV86 223 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DERL2Q9GZP9 239 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPY26PQ9H489 355 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.84□□□□□ -0.03
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A0A6YYD5 115 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM234BA2RU67 622 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LMX1BO60663 402 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFS7O75251 213 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL11P20809 199 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NT5EP21589 574 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT6P53370 316 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC2AQ6UVW9 174 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK32CQ86UX6 486 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR4K14Q8NGD5 310 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL21A1Q96P44 957 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITPAQ9BY32 194 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EHD3Q9NZN3 535 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GUCA1BQ9UMX6 200 aa14.83□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SEC14L5O43304 696 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMPRSS11DO60235 418 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC25A16P16260 332 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HNF1AP20823 631 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 S1PR1P21453 382 aa14.82□□□□□ -0.04
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DRD5P21918 477 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78 ms