RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 NCLNQ969V3 563 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 VSTM2LQ96N03 204 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 OR7D2Q96RA2 312 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 CALML5Q9NZT1 146 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 WASF3Q9UPY6 502 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HMGN4O00479 90 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PEX12O00623 359 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 SOCS6O14544 535 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 CREG1O75629 220 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 OR12D1P0DN82 309 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 ARAFP10398 606 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 COX6A1P12074 109 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 ICAM2P13598 275 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PCGF2P35227 344 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 MAN2A2P49641 1150 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 DUSP8Q13202 625 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 ZZZ3Q8IYH5 903 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 DOK4Q8TEW6 326 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 C8orf44Q96CB5 159 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 SERHL2Q9H4I8 314 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 Q9N2J8 555 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PACSIN3Q9UKS6 424 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 ANGPT4Q9Y264 503 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 SNX13Q9Y5W8 968 aa21.9■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 C5orf58C9J3I9 102 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HRKO00198 91 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 NKX2-2O95096 273 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 CLPSP04118 112 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 CLCN2P51788 898 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR143P51810 404 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HPCAP84074 193 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PLAG1Q6DJT9 500 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 KIRREL2Q6UWL6 708 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HSDL2Q6YN16 418 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 HIPK4Q8NE63 616 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 C17orf47Q8NEP4 570 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 OR11G2Q8NGC1 345 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 OR5D16Q8NGK9 328 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 OR5L2Q8NGL0 311 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 M1APQ8TC57 530 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 XAGE5Q8WWM1 108 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 C16orf58Q96GQ5 468 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 YIPF4Q9BSR8 244 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 NUDT9Q9BW91 350 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 PIF1Q9H611 641 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 ACTR3BQ9P1U1 418 aa21.89■■□□□ 1.1
TSPAN4-202ENST00000397396 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa21.89■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 HPP00738 406 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C1QCP02747 245 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ACP2P11117 423 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 F8A1P23610 371 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MAP3K8P41279 467 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CASP9P55211 416 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CDK6Q00534 326 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SCARB2Q14108 478 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 EBPQ15125 230 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C1orf146Q5VVC0 180 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PTOV1Q86YD1 416 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C10orf111Q8N326 155 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 COX18Q8N8Q8 333 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 APCDD1LQ8NCL9 501 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SIMC1Q8NDZ2 872 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 NUBPLQ8TB37 319 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BTBD9Q96Q07 612 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 POMPQ9Y244 141 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 NR2F1P10589 423 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GGT1P19440 569 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 PPICP45877 212 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 CRISP3P54108 245 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FLOT2Q14254 428 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 ADRM1Q16186 407 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DUSP5Q16690 384 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 BTBD16Q32M84 506 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MTX3Q5HYI7 312 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM69BQ5VUD6 431 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 REEP3Q6NUK4 255 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 MRGPREQ86SM8 312 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 DHFR2Q86XF0 187 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC16A11Q8NCK7 471 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FAM156AQ8NDB6 213 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FBXO30Q8TB52 745 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 GPR151Q8TDV0 419 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 FGF11Q92914 225 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 RAB8BQ92930 207 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-202ENST00000397396 IMMP1LQ96LU5 166 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms