RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 TREX1Q9NSU2 369 aa7.14□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 CHP1Q99653 195 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 CAPS2Q9BXY5 557 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 ATP23Q9Y6H3 246 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 CASP9P55211 416 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-201ENST00000393150 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa7.11□□□□□ -1.27
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