RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM153AQ9UHL3 310 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NTNG1Q9Y2I2 539 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZMYM6O95789 1325 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa1.81□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0J9YVX5 310 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A0U1RRA0 63 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM89A2RUT3 159 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 G3V3Y1 287 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC17A2O00624 439 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFSF11O14788 317 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFLARO15519 480 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SDC3O75056 442 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC2A10O95528 541 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CT45A10P0DMU9 189 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP11B1P15538 503 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALDH3B2P48448 385 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVPABLB-1P60509 514 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRP54P61011 504 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASAH1Q13510 395 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ISXQ2M1V0 245 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF699Q32M78 642 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR5LQ6MZQ0 368 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TATDN1Q6P1N9 297 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 AMZ2Q86W34 360 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TICAM2Q86XR7 235 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PEX5LQ8IYB4 626 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 MLKLQ8NB16 471 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM185AQ8NFB2 350 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR52J3Q8NH60 311 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RFESDQ8TAC1 157 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAF2Q96CS3 445 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNAJA3Q96EY1 480 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHYHIPLQ96FC7 376 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5M11Q96RB7 305 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HCAR1Q9BXC0 346 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 MIEF1Q9NQG6 463 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMG20BQ9P0W2 317 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NYAP2Q9P242 653 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.8□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 EPOPA6NHQ4 379 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM220BPB1ANY3 271 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf98E9PRG8 122 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HDAC3O15379 428 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK17BO94768 372 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 LYPD3O95274 346 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 OLFM2O95897 454 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGSF6O95976 241 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNPP00491 289 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GSTA1P08263 222 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GHRP10912 638 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNSP15586 552 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMOD1P28289 359 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRKAR2BP31323 418 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RFC2P35250 354 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 XCR1P46094 333 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGRP47804 291 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CASP9P55211 416 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARF5P84085 180 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD47Q08722 323 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 C2orf76Q3KRA6 126 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 LIPKQ5VXJ0 399 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC22A10Q63ZE4 541 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF544Q6NX49 715 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF677Q86XU0 584 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR65Q8IYL9 337 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR22Q8IZ63 422 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CEND1Q8N111 149 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPC24Q8NBT2 197 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR13F1Q8NGS4 319 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC26Q8TAB7 109 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC51Q96ER9 411 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 EEF2KMTQ96G04 330 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYYR1Q96J86 154 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBWD1Q9BRT8 395 aa1.79□□□□□ -2.12
RNU6-227P-201ENST00000362865 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP1.79□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms