RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP17.65■□□□□ 0.42
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SH3BP1-201ENST00000357436 DMPKQ09013 629 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 FUT5Q11128 374 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 ZIC1Q15915 447 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFA9Q16795 377 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM35AQ53FP2 167 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 PAQR6Q6TCH4 344 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXL6Q8N531 539 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00471Q8N535 108 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4E2Q8NGC2 313 aa17.63■□□□□ 0.41
SH3BP1-201ENST00000357436 BBS10Q8TAM1 723 aa17.63■□□□□ 0.41
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