RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC43A2Q8N370 569 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAM47BQ8NA70 645 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR4A15Q8NGL6 344 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 UCN3Q969E3 161 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TCEAL3Q969E4 200 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PANX1Q96RD7 426 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C12orf57Q99622 126 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FAIM2Q9BWQ8 316 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 EVA1AQ9H8M9 152 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PLGRKTQ9HBL7 147 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PDE7BQ9NP56 450 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF98A6NK75 572 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TXNDC9O14530 226 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 B3GALT2O43825 422 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
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CCR6-201ENST00000341935 HSD17B1P14061 328 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCNIQ14094 377 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 TBRG1Q3YBR2 411 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 USP53Q70EK8 1073 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRSS42Q7Z5A4 293 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF227Q86WZ6 799 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C11orf65Q8NCR3 313 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ASB9Q96DX5 294 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCDC120Q96HB5 630 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 STOML1Q9UBI4 398 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MLXQ9UH92 298 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZNF229Q9UJW7 825 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ATG4BQ9Y4P1 393 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PR48 441 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRR33A8MZF0 331 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 hCG_2039718K7EN88 272 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ACOT8O14734 319 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LDLRAD4O15165 306 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CASC3O15234 703 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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CCR6-201ENST00000341935 AIFM1O95831 613 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C6orf47O95873 294 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 UMPSP11172 480 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 IL1RNP18510 177 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 MS4A2Q01362 244 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRTGQ2VWP7 1150 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PROX2Q3B8N5 592 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DEFB134Q4QY38 66 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 FOXB2Q5VYV0 432 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 WDR73Q6P4I2 378 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PM20D2Q8IYS1 436 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CATSPER1Q8NEC5 780 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 ALG2Q9H553 416 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DIABLOQ9NR28 239 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SEMA5BQ9P283 1151 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C5AR2Q9P296 337 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 POU2F3Q9UKI9 436 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 IFT52Q9Y366 437 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC22A7Q9Y694 548 aa5.7□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PRB8 838 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C1orf226A1L170 272 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A17O43808 307 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 DNAJA2O60884 412 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 OR7A10O76100 309 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CKMT1AP12532 417 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 PRKCAP17252 672 aa5.69□□□□□ -1.5
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CCR6-201ENST00000341935 GSK3BP49841 420 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LIM2P55344 173 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 CCL7P80098 99 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 HSD11B2P80365 405 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 BNIP2Q12982 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 KCNAB2Q13303 367 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SQSTM1Q13501 440 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 RUNX2Q13950 521 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 NPTX1Q15818 432 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 C18orf63Q68DL7 685 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 SLC6A19Q695T7 634 aa5.69□□□□□ -1.5
CCR6-201ENST00000341935 LAIR1Q6GTX8 287 aa5.69□□□□□ -1.5
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