RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308008.10

RAPGEF6-202, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAPGEF6, Length 4,176 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-202ENST00000308008 TIRAPP58753 221 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 BTG1P62324 171 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 TRAM2Q15035 370 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 KLHL26Q53HC5 615 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 FAM182BQ5T319 152 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 SAXO2Q658L1 398 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 SFT2D1Q8WV19 159 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 PPIL1Q9Y3C6 166 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 AQP7P3A6NL99 342 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 CLIC2O15247 247 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 FABP7O15540 132 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 FAM187BQ17R55 369 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 LINGO1Q96FE5 620 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 TPD52L3Q96J77 140 aa3.05□□□□□ -1.92
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RAPGEF6-202ENST00000308008 Q96MT0 163 aa3.05□□□□□ -1.92
RAPGEF6-202ENST00000308008 WDR92Q96MX6 357 aa3.05□□□□□ -1.92
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