RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000132397.1

Gm20517-202, Transcript of Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20517, Length 4,807 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517-202ENSMUST00000132397 ItgamP05555 1153 aa16.09■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Etv4P28322 485 aa16.09■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Akirin1Q99LF1 191 aa16.09■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rassf1Q99MK9 340 aa16.09■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 3110001I22RikQ9CZ70 312 aa16.09■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ttc39aA2ACP1 578 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1303A2AVW1 312 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cep76Q0VEJ0 659 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Phf12Q5SPL2 1003 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Brinp2Q6DFY8 783 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr871Q7TRF0 311 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Supv3l1Q80YD1 779 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rnf38Q8BI21 518 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pop7Q9DCH2 140 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il23aQ9EQ14 196 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Lrrc72A0A1Y7VMI0 288 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm3099J3QPA5 205 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm17026K7N6Z0 213 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpr75Q6X632 540 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tpra1Q99MU1 369 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Enpp2Q9R1E6 862 aa16.08■□□□□ 0.17
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm10718D3Z1I7 227 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 GnrhrQ01776 327 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc15a3Q8BPX9 578 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cldn17Q8BXA6 224 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SdslQ8R238 329 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem185bQ8R3R5 350 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cdt1Q8R4E9 557 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ubox5Q925F4 539 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Sacm1lQ9EP69 587 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r96E9PZU5 664 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Man2a1P27046 1150 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gpx3P46412 226 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Fgf13P70377 245 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Defb25Q30KN8 71 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SctrQ5FWI2 447 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem125Q8CHQ6 216 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr854Q8VFF1 315 aa16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Igkv10-96A0A140T8M1 115 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r110E9PWD5 858 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tyrp1P07147 537 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SrgnP13609 152 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TP20293 436 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Hoxa10P31310 416 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cd244Q07763 397 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tstd2Q3U269 495 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Usp22Q5DU02 525 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Slc36a3Q811P0 477 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tns4Q8BZ33 696 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Chpt1Q8C025 398 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 SgtbQ8VD33 304 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr811Q8VFI1 319 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp65Q91W94 390 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Psmd8Q9CX56 353 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H2afb1S4R1E0 115 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 H2afb3S4R1G7 115 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp534A2A7A1 661 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp21P03940 487 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Rab8bP61028 207 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vdac3Q60931 283 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BC080695Q66JY9 481 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Echs1Q8BH95 290 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Mal2Q8BI08 175 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt6Q8CH40 313 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Neto1Q8R4I7 533 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Marc2Q922Q1 338 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Ufsp2Q99K23 461 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pramef25A2ASI9 494 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp395E9Q5N9 508 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 FaimlJ3QPY3 178 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pdlim3O70209 316 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Zfp791Q497V9 528 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NaxeQ8K4Z3 282 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 PpcsQ8VDG5 311 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 NtpcrQ9CQA9 190 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Taf8Q9EQH4 308 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Cyp2j5O54749 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 BckdkO55028 412 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 P01636 108 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Nudt19P11930 357 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Il1r2P27931 410 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Dyrk2Q5U4C9 599 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 TmieQ8K467 153 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 DutQ8VCG1 200 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Wdr74Q8VCG3 384 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Tmem53Q9D0Z3 276 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 D10Jhu81eQ9D172 266 aa16.07■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 A0A286YDM2 672 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr1056A2AVY0 313 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r34E9PVI0 852 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r40F6W043 852 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r37F8VQD3 802 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Olfr190K7N5T5 307 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Vmn2r36K7N741 852 aa16.06■□□□□ 0.16
Gm20517-202ENSMUST00000132397 Pias3O54714 628 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 42.3 ms