RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638107.1

5S_rRNA.28-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 119 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSD17B3P37058 310 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLCO1A2P46721 670 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ALDH9A1P49189 494 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EMDP50402 254 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SERPINB9P50453 376 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NAGLUP54802 743 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CLCQ05315 142 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MAP4K2Q12851 820 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NHSL2Q5HYW2 709 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TEX35Q5T0J7 233 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TIGD3Q6B0B8 471 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM81Q6P7N7 255 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PAGE2Q7Z2X7 111 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDC20BQ86Y33 519 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CCDC116Q8IYX3 515 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OR52R1Q8NGF1 315 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RDH11Q8TC12 318 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRPC4APQ8TEL6 797 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DCAKDQ8WVC6 231 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IFT81Q8WYA0 676 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NINJ1Q92982 152 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CTHRC1Q96CG8 243 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 OMA1Q96E52 524 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF681Q96N22 645 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FMO2Q99518 471 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FOXC2Q99958 501 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 BRF2Q9HAW0 419 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMEM216Q9P0N5 145 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HEY2Q9UBP5 337 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TRPS1Q9UHF7 1281 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CFL2Q9Y281 166 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NINQ8N4C6 2090 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PKDREJQ9NTG1 2253 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PRAMEF25A6NGN4 478 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FRG2CA6NGY1 282 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 C17orf51A8MQB3 221 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 B4DXG7 233 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACOX3O15254 700 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TSPAN2O60636 221 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CDH16O75309 829 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KRT38O76015 456 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SUPT7LO94864 414 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ESRRBO95718 433 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ACTL6AO96019 429 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 IL3P08700 152 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RHOXF2BP0C7M4 288 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CTAGE8P0CG41 777 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A8P0DMV1 189 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A9P0DMV2 189 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CD99P14209 185 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PCSK2P16519 638 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 NAGAP17050 411 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 KLK2P20151 261 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DRD5P21918 477 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CTSSP25774 331 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 GCAP28676 217 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PEX19P40855 299 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PPICP45877 212 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 STARP49675 285 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 HTR6P50406 440 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 DGKQP52824 942 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SRYQ05066 204 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 PLCXD2Q0VAA5 305 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 FOXF2Q12947 444 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 RCAN2Q14206 197 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 UNC50Q53HI1 259 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 CT45A2Q5DJT8 189 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF628Q5EBL2 1059 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 ZNF678Q5SXM1 525 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.38□□□□□ -1.55
5S_rRNA.28-201ENST00000638107 TAOK1Q7L7X3 1001 aa5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms