RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	MLC1	Q15049	377 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RPE65	Q16518	533 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP6	Q16828	381 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	VRK2	Q86Y07	508 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	DOK4	Q8TEW6	326 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C17orf50	Q8WW18	174 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM203	Q969S6	136 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	WBP1L	Q9NX94	342 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152		A0A1W2PRQ8	180 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	HBQ1	P09105	142 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ALOX5	P09917	674 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GSTM5	P46439	218 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LIMK1	P53667	647 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SMIM11A	P58511	58 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CHRNE	Q04844	493 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MXD1	Q05195	221 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C12orf73	Q69YU5	71 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	EHD3	Q9NZN3	535 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CNIH4	Q9P003	139 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	POM121B	A6NF01	834 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152		H0Y8X5	98 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	BTN3A3	O00478	584 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MED26	O95402	600 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LGI1	O95970	557 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SCG5	P05408	212 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GPR89B	P0CG08	455 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PBX2	P40425	430 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	AVPR1B	P47901	424 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GIPR	P48546	466 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ZIC1	Q15915	447 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SNAPC1	Q16533	368 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF311	Q5JNZ3	666 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FUZ	Q9BT04	418 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	APOO	Q9BUR5	198 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	12.32	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TRIO	O75962	3097 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TAF4	O00268	1085 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MYL12B	O14950	172 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CYP7B1	O75881	506 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PCYT1A	P49585	367 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TAS2R41	P59536	307 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	BBS10	Q8TAM1	723 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CEP19	Q96LK0	163 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	OR7D2	Q96RA2	312 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	C1QTNF2	Q9BXJ5	285 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ASPN	Q9BXN1	380 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	CFL2	Q9Y281	166 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	AGRP	O00253	132 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LINC01565	O15544	149 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	LRRTM2	O43300	516 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FCMR	O60667	390 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	FH	P07954	510 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	MPI	P34949	423 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SYT14P1	Q58G82	188 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		12.31	□□□□□ -0.44
BRF1-222	ENST00000635152	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		12.31	□□□□□ -0.44

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