RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 RPS6KA2Q15349 733 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 HYAL4Q2M3T9 481 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 GALNTL6Q49A17 601 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 C1QL3Q5VWW1 255 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 KAT2AQ92830 837 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 MAGED4Q96JG8 741 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PLSCR2Q9NRY7 297 aa22.91■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ACOT7O00154 380 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TP53I11O14683 189 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 HSPA4LO95757 839 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DRD5P21918 477 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 GRK2P25098 689 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ABCD3P28288 659 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NTSP30990 170 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PPICP45877 212 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 DNASE1L1P49184 302 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PPIAP62937 165 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 PLGLB1Q02325 96 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 TMEM64Q6YI46 380 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A16Q86VW1 577 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SPPL2CQ8IUH8 684 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
PMS1-220ENST00000618056 A0A087WV62 115 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ANKRD33BA6NCL7 494 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ITM2AO43736 263 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SASH3O75995 380 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 BCKDHAP12694 445 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PIGAP37287 484 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ASMTP46597 345 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.255e-8■■■□□ 15.7
PMS1-220ENST00000618056 SLC18A1P54219 525 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TBCELQ5QJ74 424 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 FJX1Q86VR8 437 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 OR7G2Q8NG99 324 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 OR52N2Q8NGI0 321 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 C3orf30Q96M34 536 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TSSK3Q96PN8 268 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 BTBD9Q96Q07 612 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ACBD3Q9H3P7 528 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 REEP4Q9H6H4 257 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ANKRA2Q9H9E1 313 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PROK2Q9HC23 129 aa22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 FRG2CA6NGY1 282 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PLOD2O00469 737 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TO15178 435 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 JUNP05412 331 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 IFI6P09912 130 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 MAPK1P28482 360 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 CASP6P55212 293 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 FBXW4P57775 412 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 HSF1Q00613 529 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PDE7AQ13946 482 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 CASP8Q14790 479 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TLCD1Q96CP7 247 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 AMDHD1Q96NU7 426 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 GLIPR2Q9H4G4 154 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 RAP2CQ9Y3L5 183 aa22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 FAM166BA8MTA8 275 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PSPHP78330 225 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 NNATQ16517 81 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PRAMEF20Q5VT98 475 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 OR5M3Q8NGP4 307 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 MTERF3Q96E29 417 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 VSTM2LQ96N03 204 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SORT1Q99523 831 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 C20orf27Q9GZN8 174 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 FAM53CQ9NYF3 392 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TAS2R9Q9NYW1 312 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 GIMAP2Q9UG22 337 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 HAO1Q9UJM8 370 aa22.87■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 TMEM120BA0PK00 339 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PEX11AO75192 247 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 PPM1BO75688 479 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ATP6AP2O75787 350 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 BGNP21810 368 aa22.86■■□□□ 1.25
PMS1-220ENST00000618056 SLC1A6P48664 564 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms