RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 CHAF1BQ13112 559 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ART3Q13508 389 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TP53BP2Q13625 1128 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MYBPC3Q14896 1274 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 BTBD16Q32M84 506 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GTDC1Q4AE62 458 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DCAF10Q5QP82 559 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NANOGP8Q6NSW7 305 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MFSD12Q6NUT3 480 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 H3F3CQ6NXT2 135 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 HSDL2Q6YN16 418 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ARPINQ7Z6K5 226 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZNF321PQ8N8H1 164 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR52R1Q8NGF1 315 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR8J3Q8NGG0 315 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR5AK3PQ8NH89 298 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C16orf52Q8NHV5 167 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NUBPLQ8TB37 319 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DOK4Q8TEW6 326 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 VSTM2LQ96N03 204 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SH3GL1Q99961 368 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ACTRT3Q9BYD9 372 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RAD21L1Q9H4I0 556 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NANOGQ9H9S0 305 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 BCAP29Q9UHQ4 241 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CORO2BQ9UQ03 480 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 POLHQ9Y253 713 aa10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EVPLLA8MZ36 301 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 B2RBV5 119 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TAF4O00268 1085 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ASNA1O43681 348 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 BMP2P12643 396 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SLC6A2P23975 617 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PPICP45877 212 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CPA2P48052 419 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MAN2A2P49641 1150 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RRADP55042 308 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 UCNP55089 124 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DCAF7P61962 342 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 RNF4P78317 190 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PSPHP78330 225 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TLE3Q04726 772 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 Q0VFX4 171 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 FADDQ13158 208 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EBPQ15125 230 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 BROXQ5VW32 411 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CDC73Q6P1J9 531 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CCDC81Q6ZN84 652 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SLC29A4Q7RTT9 530 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C9orf40Q8IXQ3 194 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 KBTBD2Q8IY47 623 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CLEC4FQ8N1N0 589 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZNF441Q8N8Z8 693 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CDRT4Q8N9R6 151 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR52N2Q8NGI0 321 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 OR5L2Q8NGL0 311 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ADIPOR1Q96A54 375 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TP53INP1Q96A56 240 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 MAGED4Q96JG8 741 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 SLC35G5Q96KT7 338 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 BTBD9Q96Q07 612 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 WWTR1Q9GZV5 400 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 IL1RL2Q9HB29 575 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 FOLH1BQ9HBA9 442 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DUSP22Q9NRW4 184 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TAS2R1Q9NYW7 299 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AP3M1Q9Y2T2 418 aa10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 EPG5Q9HCE0 2579 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 TMEM200CA6NKL6 621 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 DUXAA6NLW8 204 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 K7ENP7 123 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 ZFAND5O76080 213 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 NKX2-2O95096 273 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 AGR2O95994 175 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 C1QCP02747 245 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CT45A8P0DMV1 189 aa10.67□□□□□ -0.7
GGA3-211ENST00000582232 CT45A9P0DMV2 189 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms