RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACBD4	Q8NC06	268 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ERP27	Q96DN0	273 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	RILP	Q96NA2	401 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	UBQLN3	Q9H347	655 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOX3	O15254	700 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PPM1B	O75688	479 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX4	O95219	450 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	DRD5	P21918	477 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ACVR2A	P27037	513 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	KIR3DL1	P43629	444 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIC	P45877	212 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PCLAF	Q15004	111 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	NNAT	Q16517	81 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL6	Q6ICC9	239 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM81	Q6P7N7	255 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TRABD2A	Q86V40	505 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC63	Q8NA47	563 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9A2	Q8NGT5	310 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	HGD	Q93099	445 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF597	Q96LX8	424 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	LDAH	Q9H6V9	325 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PRODH2	Q9UF12	536 aa		19.95	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	T	O15178	435 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	UROS	P10746	265 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	DDC	P20711	480 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PTGER4	P35408	488 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAF7	P61962	342 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA0040	Q15053	153 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	DESI1	Q6ICB0	168 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	BANP	Q8N9N5	519 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RND1	Q92730	232 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SARAF	Q96BY9	339 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	JSRP1	Q96MG2	331 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	EXO1	Q9UQ84	846 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF6	Q9Y252	685 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	HCFC1	P51610	2035 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		19.94	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TLDC2	A0PJX2	215 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PRPH2	P23942	346 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP107	P57740	925 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PMPCA	Q10713	525 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM198	Q66K66	360 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM71E1	Q6IPT2	247 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAD11	Q709F0	780 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	KAT2A	Q92830	837 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	OMA1	Q96E52	524 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	APOPT1	Q96IL0	206 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD9	Q96Q07	612 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	GATA5	Q9BWX5	397 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	RUBCNL	Q9H714	662 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	MYNN	Q9NPC7	610 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	WBP11	Q9Y2W2	641 aa	Known RBP	19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	FRG2C	A6NGY1	282 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PLOD3	O60568	738 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A8	P0DMV1	189 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A9	P0DMV2	189 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	COX6B1	P14854	86 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CHRNB4	P30926	498 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	C2orf80	Q0P641	193 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	IMPG1	Q17R60	797 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR93	Q6P2C0	686 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	PACS2	Q86VP3	889 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		19.93	■□□□□ 0.78
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB5	Q8WWX0	329 aa		19.93	■□□□□ 0.78

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