RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526286.1

NANOG-202, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-202ENST00000526286 SPARTQ8N0X7 666 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 AQP11Q8NBQ7 271 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 OR9Q2Q8NGE9 314 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 OR13F1Q8NGS4 319 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 OR52J3Q8NH60 311 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CNIH3Q8TBE1 160 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DNASE2BQ8WZ79 361 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 KAT2AQ92830 837 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PMM1Q92871 262 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 C16orf58Q96GQ5 468 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ZNF285Q96NJ3 590 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 NODALQ96S42 347 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 STACQ99469 402 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ARHGDIGQ99819 225 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SLC38A1Q9H2H9 487 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ANKRD19PQ9H560 264 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DUSP21Q9H596 190 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 EVA1AQ9H8M9 152 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CXorf21Q9HAI6 301 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 EQTNQ9NQ60 294 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 KLHL28Q9NXS3 571 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SATB2Q9UPW6 733 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 IFT52Q9Y366 437 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa9.6□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 A0A1W2PRQ8 180 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FFAR1O14842 300 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FGF17O60258 216 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FAM20BO75063 409 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 COQ9O75208 318 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PIAS2O75928 621 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SEC14L2O76054 403 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ALOX5P09917 674 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 RNH1P13489 461 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 NT5EP21589 574 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PTGER1P34995 402 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CXCL12P48061 93 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 RGS19P49795 217 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 EMP3P54852 163 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CDC42P60953 191 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 SLC35A2P78381 396 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 LSAMPQ13449 338 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DGCR6Q14129 220 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 NEDD8Q15843 81 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 INAVAQ3KP66 663 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 EIPR1Q53HC9 387 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ZNF311Q5JNZ3 666 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 TCTE1Q5JU00 501 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 MLIPQ5VWP3 458 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 GPR153Q6NV75 609 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 P3H2Q8IVL5 708 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ENTHD1Q8IYW4 607 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DEFB119Q8N690 84 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CDRT4Q8N9R6 151 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 OR6C4Q8NGE1 309 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 C1orf216Q8TAB5 229 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FAM81AQ8TBF8 368 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 MUL1Q969V5 352 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ISOC1Q96CN7 298 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DOK1Q99704 481 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FUZQ9BT04 418 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 UCK2Q9BZX2 261 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PIGUQ9H490 435 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FANCEQ9HB96 536 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FAM60AQ9NP50 221 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 POLE3Q9NRF9 147 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 DUSP22Q9NRW4 184 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 RLIMQ9NVW2 624 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 FTSJ1Q9UET6 329 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 A4GNTQ9UNA3 340 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 RNF6Q9Y252 685 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
NANOG-202ENST00000526286 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms