RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521364.5

CSNK1G3-210, Transcript of casein kinase 1 gamma 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CSNK1G3, Length 2,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G3-210ENST00000521364 PHKG1Q16816 387 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ODF4Q2M2E3 257 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLX4IPQ5VYV7 408 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 KCNMB4Q86W47 210 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 MFSD9Q8NBP5 474 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 DTX3LQ8TDB6 740 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR148Q8TDV2 347 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC35C1Q96A29 364 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 MYEOVQ96EZ4 313 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 COPS8Q99627 209 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 POT1Q9NUX5 634 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 IL20Q9NYY1 176 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPIAL4AQ9Y536 164 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 NEURL4Q96JN8 1562 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PTPRCP08575 1304 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMCO3A2RU48 225 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 C5orf60A6NFR6 353 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 LAMTOR5O43504 91 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 KDELR3O43731 214 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GLRA3O75311 464 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 RNF8O76064 485 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 CHRNB1P11230 501 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PSMA2P25787 234 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 TFDP1Q14186 410 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR1C1Q15619 314 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 MRGPREQ86SM8 312 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GABRG1Q8N1C3 465 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PRSS35Q8N3Z0 413 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 THAP6Q8TBB0 222 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 LRRC15Q8TF66 581 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 LRRC45Q96CN5 670 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ERGIC2Q96RQ1 377 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 DUSP16Q9BY84 665 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PSTPIP2Q9H939 334 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 MAP6D1Q9H9H5 199 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SNED1Q8TER0 1413 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PLSCR5A0PG75 271 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR5K3A6NET4 321 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMIM22K7EJ46 135 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 KIR2DS3K7RE56 304 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 STX11O75558 287 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCGNO76038 276 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ALOX5P09917 674 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 UQCRBP14927 111 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARSBP15848 533 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SLURP1P55000 103 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAG2P55895 527 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GHRHRQ02643 423 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SRYQ05066 204 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 TAF13Q15543 124 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 NADSYN1Q6IA69 706 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 DEF8Q6ZN54 512 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 Q6ZNX1 250 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 COLCA1Q6ZS62 124 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 CEP112Q8N8E3 955 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 STXBP6Q8NFX7 210 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR51L1Q8NGJ5 315 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 CD99L2Q8TCZ2 262 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 LPAR2Q9HBW0 351 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 EURLQ9NYK6 297 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 RAI2Q9Y5P3 530 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 TAF1P21675 1872 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SCO2A0A1W2PP80 73 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 IMPA2O14732 288 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SH2D1BO14796 132 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 OR2J3O76001 311 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 NXPH2O95156 264 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 FGF5P12034 268 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 COMTP21964 271 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 PDX1P52945 283 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GSCP56915 257 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ERVK-8P63133 956 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 ETFDHQ16134 617 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 GPR33Q49SQ1 333 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 SFT2D3Q587I9 215 aa4.99□□□□□ -1.61
CSNK1G3-210ENST00000521364 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms