RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 CD163Q86VB7 1156 aa17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 TAGAPQ8N103 731 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TP53INP1Q96A56 240 aa17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 TSSK3Q96PN8 268 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PHF12Q96QT6 1004 aa17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 HRH3Q9Y5N1 445 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa17.19■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 MED12Q93074 2177 aa17.19■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 PER3P56645 1201 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 XKR7Q5GH72 579 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 GIMAP4Q9NUV9 329 aa17.18■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 ADAM10O14672 748 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CTIFO43310 598 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ATP6AP2O75787 350 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 DHRS4L1P0CG22 281 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 IKBIPQ70UQ0 350 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A16Q86VW1 577 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 DOLPP1Q86YN1 238 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM109AQ8N4B1 249 aa17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 RPRMLQ8N4K4 120 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 OMA1Q96E52 524 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 CELSR2Q9HCU4 2923 aa17.17■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 CHEK2O96017 543 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TPOP07202 933 aa17.16■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 NRG3P56975 720 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 PLCXD2Q0VAA5 305 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CHI3L2Q15782 390 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 HYAL4Q2M3T9 481 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP17.16■□□□□ 0.342e-6■□□□□ 8.1
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SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF787Q6DD87 383 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CLYBLQ8N0X4 340 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 MARVELD2Q8N4S9 558 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM57AQ8TBR7 257 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 HGDQ93099 445 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 RILPQ96NA2 401 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 AMDHD1Q96NU7 426 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD9Q96Q07 612 aa17.16■□□□□ 0.34
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SH3BP2-218ENST00000511185 DOHHQ9BU89 302 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 C1orf50Q9BV19 199 aa17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 FRG2CA6NGY1 282 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT2B11O75310 529 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A8P0DMV1 189 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 CT45A9P0DMV2 189 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 BGNP21810 368 aa17.15■□□□□ 0.34
SH3BP2-218ENST00000511185 NTSP30990 170 aa17.15■□□□□ 0.34
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