RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 MOSPD2Q8NHP6 518 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 A0A1B0GTQ1 180 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 SLITRK2Q9H156 845 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 PPM1DO15297 605 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 ZNF619Q8N2I2 560 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A20Q9NP91 592 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 SMSP52788 366 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 OR4N4Q8N0Y3 316 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 OR5D16Q8NGK9 328 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF354BQ96LW1 612 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 DGCR6LQ9BY27 220 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.78□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 LOXL2Q9Y4K0 774 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.77□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 OR7D2Q96RA2 312 aa7.77□□□□□ -1.16
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PTPRD-211ENST00000486161 DSCR3O14972 297 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SOD1P00441 154 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 ETS2P15036 469 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 SLC6A8P48029 635 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRD-211ENST00000486161 AQP4P55087 323 aa7.77□□□□□ -1.17
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