RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EVPLQ92817 2033 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC119BA6NIH7 251 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCNOP22674 350 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALG1LQ6GMV1 187 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC25A25Q6KCM7 469 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf40Q86WS4 652 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GID4Q8IVV7 300 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTMT1Q9BV86 223 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCG5Q9H222 651 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KLF15Q9UIH9 416 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1B0GVG6 124 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAP00813 363 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C5AR1P21730 350 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OPRL1P41146 370 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 WDR5P61964 334 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MED11Q9P086 117 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LHX3Q9UBR4 397 aa15.75■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DOCK1Q14185 1865 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SCGNO76038 276 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRH1P02810 166 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HCKP08631 526 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TIMP2P16035 220 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC20Q8TCA0 184 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PDE7BQ9NP56 450 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM30AQ9NV96 361 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FBXL3Q9UKT7 428 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SSC5DA1L4H1 1573 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SBF2Q86WG5 1849 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MROH6A6NGR9 719 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NUAK1O60285 661 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNAJB5O75953 348 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGFP49763 221 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASB11Q8WXH4 323 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HEBP1Q9NRV9 189 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM26DQ5JW98 314 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FCRLBQ6BAA4 426 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRFN4Q6PJG9 635 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.74■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 I3L521 148 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2B3O76000 313 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGDIBP52566 201 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAS2R43P59537 309 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELOCQ15369 112 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.116e-7■□□□□ 10.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PROX2Q3B8N5 592 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C1orf189Q5VU69 101 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ULK3Q6PHR2 472 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HTR3DQ70Z44 454 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NELL2Q99435 816 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRODH2Q9UF12 536 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCG2Q9UNQ0 655 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APC2O95996 2303 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP15.73■□□□□ 0.112e-7■■■■□ 21.2
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FXYD6P3P58550 94 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HSD17B12Q53GQ0 312 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM225Q6GV28 225 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPARTQ8N0X7 666 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR9A2Q8NGT5 310 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR2AT4A6NND4 320 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPIPA7E9PJI5 369 aa15.73■□□□□ 0.11
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARNTLO00327 626 aa15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms