RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR1F1	O43749	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	B4GALT2	O60909	372 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTTG1	O95997	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ITGAM	P11215	1152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SSTR4	P31391	388 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NPRL3	Q12980	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PDE7A	Q13946	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GPAT3	Q53EU6	434 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	METRNL	Q641Q3	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SZRD1	Q7Z422	152 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C12orf66	Q96MD2	445 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYNN	Q9NPC7	610 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A0B4J203	849 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278		H0YC42	278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TNFRSF11B	O00300	401 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PCDH17	O14917	1159 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMPRSS11D	O60235	418 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C9	P02748	559 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MT-ND2	P03891	347 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APOD	P05090	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RYK	P34925	604 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NUDT6	P53370	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CDK6	Q00534	326 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HYAL1	Q12794	435 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPA4	Q13156	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KRT73	Q86Y46	540 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FKBP10	Q96AY3	582 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CD93	Q9NPY3	652 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TOX	O94900	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KDM4B	O94953	1096 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAPK9	P45984	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CTAG1A	P78358	180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NDUFAF5	Q5TEU4	345 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MUL1	Q969V5	352 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278		A0A1W2PS29	197 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AGAP5	A6NIR3	686 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC35G4	P0C7Q5	338 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYL9	P24844	172 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BSG	P35613	385 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BHLHB9	Q6PI77	547 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CORO6	Q6QEF8	472 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PLET1	Q6UQ28	207 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LCTL	Q6UWM7	567 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TM4SF18	Q96CE8	201 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WDR26	Q9H7D7	661 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CA5B	Q9Y2D0	317 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC31A1	O15431	190 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LAMP2	P13473	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PIK3CB	P42338	1070 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	QPRT	Q15274	297 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RFX4	Q33E94	735 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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