RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	RILP	Q96NA2	401 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNJ16	Q9NPI9	418 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HEY2	Q9UBP5	337 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PRODH2	Q9UF12	536 aa		11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	GPR55	Q9Y2T6	319 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A0G2JNJ9	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FRG2C	A6NGY1	282 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	GLRA3	O75311	464 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SLITRK5	O94991	958 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PROC	P04070	461 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PYGB	P11216	843 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TSPAN8	P19075	237 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	NT5E	P21589	574 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PRPH2	P23942	346 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CRHR1	P34998	444 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ADH7	P40394	386 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PTGDS	P41222	190 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HTR6	P50406	440 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TESK1	Q15569	626 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SGO1	Q5FBB7	561 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM198	Q66K66	360 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TIGD3	Q6B0B8	471 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	VASN	Q6EMK4	673 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM111B	Q6SJ93	734 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	RDH11	Q8TC12	318 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	DIO2	Q92813	273 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL29	Q96CT2	875 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC35A4	Q96G79	324 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	VSTM2L	Q96N03	204 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307		Q9UFV3	132 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	NCKAP5	O14513	1909 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FREM3	P0C091	2139 aa		11.3	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307		A0A087WV62	115 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	SNPH	O15079	494 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PCDH7	O60245	1069 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PLIN3	O60664	434 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ABCB7	O75027	752 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PSMG1	O95456	288 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	EPPIN	O95925	133 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CT45A8	P0DMV1	189 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CT45A9	P0DMV2	189 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CHN1	P15882	459 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PTPN6	P29350	595 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HMOX2	P30519	316 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TIMP3	P35625	211 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FEN1	P39748	380 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC153	Q494R4	210 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	TRMT12	Q53H54	448 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PACS2	Q86VP3	889 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	C16orf78	Q8WTQ4	265 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	APIP	Q96GX9	242 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	UCN2	Q96RP3	112 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HBEGF	Q99075	208 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ITPA	Q9BY32	194 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	LDAH	Q9H6V9	325 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	MKS1	Q9NXB0	559 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	UTS2R	Q9UKP6	389 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	DLGAP4	Q9Y2H0	992 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PLLP	Q9Y342	182 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CCL27	Q9Y4X3	112 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		11.29	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM221A	A4D161	298 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	CD8B2	A6NJW9	211 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	HSPB2	A8KAH6	182 aa		11.28	□□□□□ -0.6
PGAP2-215	ENST00000469307	PLOD2	O00469	737 aa		11.28	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms