RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 P2RX2Q9UBL9 471 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 WNT16Q9UBV4 365 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 RAB23Q9ULC3 237 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 POFUT2Q9Y2G5 429 aa5.3□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SNX8Q9Y5X2 465 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0J9YVX5 310 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 FITM1A5D6W6 292 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 H3BMQ9 156 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 K7ESF4 209 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC28A2O43868 658 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 PLOD3O60568 738 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 LYPD3O95274 346 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 VIPP01282 170 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 INHBBP09529 407 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC15A1P46059 708 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 TP53BP2Q13625 1128 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 SPEM1Q8N4L4 309 aa5.29□□□□□ -1.56
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PTPRC-210ENST00000462363 COL21A1Q96P44 957 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A4EQ96PG1 132 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ALPK1Q96QP1 1244 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 OR7D2Q96RA2 312 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 BBS4Q96RK4 519 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF607Q96SK3 696 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRC-210ENST00000462363 ACTRT3Q9BYD9 372 aa5.29□□□□□ -1.56
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