RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GLIPR2Q9H4G4 154 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PTGFRNQ9P2B2 879 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TRIM33Q9UPN9 1127 aa9.85□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6C76A6NM76 312 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 E9PBE3 544 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 IFI6P09912 130 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CT62P0C5K7 136 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 S1PR1P21453 382 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SOX11P35716 441 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MANFP55145 182 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 STX1BP61266 288 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 UFM1P61960 85 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MLC1Q15049 377 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LTB4RQ15722 352 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MEP1AQ16819 746 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MPEG1Q2M385 716 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DPY19L1Q2PZI1 675 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PGS1Q32NB8 556 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ABHD17BQ5VST6 288 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL21CQ5VZV1 264 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CGB2Q6NT52 195 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 HPS6Q86YV9 775 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MIER2Q8N344 545 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DOK4Q8TEW6 326 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TM9SF4Q92544 642 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MIB2Q96AX9 1013 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DUSP26Q9BV47 211 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 STMN3Q9NZ72 180 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF639Q9UID6 485 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CFL2Q9Y281 166 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 LRCH1Q9Y2L9 728 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 HRKO00198 91 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PLOD2O00469 737 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CDK2AP1O14519 115 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 PLOD3O60568 738 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 E2F6O75461 281 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A3O75751 556 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CD97P48960 835 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ARFIP2P53365 341 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 NME5P56597 212 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RNF4P78317 190 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 MFAP5Q13361 173 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ACER2Q5QJU3 275 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM154Q6P9G4 183 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC29A4Q7RTT9 530 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM13CQ8NE31 585 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8J2Q8NGG1 315 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 OR10A5Q9H207 317 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 CDCP1Q9H5V8 836 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 EPS8L2Q9H6S3 715 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 ABI3Q9P2A4 366 aa9.84□□□□□ -0.83
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A087WV62 115 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 A0A1W2PRB8 838 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 DCTN3O75935 186 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SSTR4P31391 388 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 S100A3P33764 101 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 GPC1P35052 558 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 KIR3DL1P43629 444 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP4BP51164 291 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC37A1P57057 533 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 IGFL2Q6UWQ7 119 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ASB18Q6ZVZ8 466 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF615Q8N8J6 731 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TEX19Q8NA77 164 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 NUBPLQ8TB37 319 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 OR5P2Q8WZ92 322 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 KAT2AQ92830 837 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 MARK4Q96L34 752 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM45AQ9NWC5 275 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 STOML1Q9UBI4 398 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRODH2Q9UF12 536 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 BCAP29Q9UHQ4 241 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 SCOCQ9UIL1 159 aa9.83□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 K7EM74 188 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 FCHO1O14526 889 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF2O60811 474 aa9.82□□□□□ -0.84
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP6V1G1O75348 118 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms