RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439961.2

SUMO1P3-201, Transcript of SUMO1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SUMO1P3, Length 304 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P3-201ENST00000439961 LCMT1Q9UIC8 334 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 VPS28Q9UK41 221 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 EMCNQ9ULC0 261 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ERVK-19Q9WJR5 959 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SNX8Q9Y5X2 465 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ETV7Q9Y603 341 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 KMT2DO14686 5537 aa0.2□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 A0A096LNJ9 63 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 A0A0A6YYD4 124 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 A0A1B0GW55 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CCDC162PA2VCL2 907 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 USP27XA6NNY8 438 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 YJEFN3A6XGL0 299 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 COLCA2A8K830 154 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 YDJCA8MPS7 323 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ZNF878C9JN71 531 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CYB561D2O14569 222 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CFLARO15519 480 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 B4GALT5O43286 388 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PPIP5K2O43314 1243 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 B4GAT1O43505 415 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 EFNA2O43921 213 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CSO75390 466 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 TADA2AO75478 443 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PDE5AO76074 875 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CELF2O95319 508 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ANP32DO95626 131 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SLC16A8O95907 504 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PNPP00491 289 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RPN1P04843 607 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 FCER2P06734 321 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR52Z1P0C646 297 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L2P0CJ85 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L3P0CJ86 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L5P0CJ88 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L6P0CJ89 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L7P0CJ90 424 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CT45A8P0DMV1 189 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CT45A9P0DMV2 189 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CYP3A5P20815 502 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 HNF1AP20823 631 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 GLRA1P23415 457 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SRD5A2P31213 254 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 IL2RGP31785 369 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RDXP35241 583 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DLSTP36957 453 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 NNMTP40261 264 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ID1P41134 155 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 MAGEB1P43366 347 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RPS10P46783 165 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CAPZA2P47755 286 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 NPBWR1P48145 328 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RPS8P62241 208 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ACTA2P62736 377 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ACTC1P68032 377 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ACTA1P68133 377 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 UBXN1Q04323 297 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PUDPQ08623 228 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 BNIP1Q12981 228 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SLAQ13239 276 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ARFRP1Q13795 201 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 NFE2L1Q14494 772 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 PSMD6Q15008 389 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 IRF4Q15306 451 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR1C1Q15619 314 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CD226Q15762 336 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ZIC1Q15915 447 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 TAF9Q16594 264 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ABCA11PQ4W5N1 156 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 CT45A2Q5DJT8 189 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 GPR139Q6DWJ6 353 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 OLFM4Q6UX06 510 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 BTNL8Q6UX41 500 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 BRD3OSQ6XYD6 125 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 IL34Q6ZMJ4 242 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 Q6ZRG5 221 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 Q6ZS52 159 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 RNF165Q6ZSG1 346 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 C6orf120Q7Z4R8 191 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 GPR142Q7Z601 462 aa0.19□□□□□ -2.38
SUMO1P3-201ENST00000439961 ADCK2Q7Z695 626 aa0.19□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms