RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAM15Q13444 863 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CCINQ13939 588 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPRNQ16849 979 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ATAT1Q5SQI0 421 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM240Q5SV17 173 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 MIB1Q86YT6 1006 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR4L1Q8NH43 312 aa7.96□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 DDOQ99489 341 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CTSFQ9UBX1 484 aa7.96□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 POMT2Q9UKY4 750 aa7.96□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 WASH4PA8MWX3 477 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 B4E171 279 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf67F2Z3F1 127 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 H7C0S8 307 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 J3KTA2 159 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 FGF2P09038 288 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CKBP12277 381 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 BPIP17213 487 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TACR1P25103 407 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HSPA7P48741 367 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 ST3GAL2Q16842 350 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZSWIM7Q19AV6 140 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FCRLBQ6BAA4 426 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CLEC20AQ6ZU45 233 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PANX1Q96RD7 426 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NLNQ9BYT8 704 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 EXTL2Q9UBQ6 330 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 GDF5P43026 501 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENOPP49908 381 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DAOAP59103 153 aa7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR2M2Q96R28 347 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ATF6BQ99941 703 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CLCA2Q9UQC9 943 aa7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM227AF5H4B4 570 aa7.94□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FPGTO14772 594 aa7.94□□□□□ -1.14
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