RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 CNIH4Q9P003 139 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PSME2Q9UL46 239 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 RNF6Q9Y252 685 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 FAM215AQ9Y5M1 114 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CSMD2Q7Z408 3487 aa12.69□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GVC2 190 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CCDC151A5D8V7 595 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C2orf72A6NCS6 295 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 AQP7O14520 342 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TP53I11O14683 189 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 DRD2P14416 443 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 COX6B1P14854 86 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 AGAP20933 346 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CASP3P42574 277 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 MASP1P48740 699 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TMED10P49755 219 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CORO7P57737 925 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 DNAJB13P59910 316 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ZNF763Q0D2J5 394 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C2orf80Q0P641 193 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PLCXD2Q0VAA5 305 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PMPCAQ10713 525 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 LIPMQ5VYY2 423 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TRABD2AQ86V40 505 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TICAM1Q8IUC6 712 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 EID3Q8N140 333 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 RDH11Q8TC12 318 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ZBTB9Q96C00 473 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 OMA1Q96E52 524 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 APOPT1Q96IL0 206 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 FAM111AQ96PZ2 611 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 UCK2Q9BZX2 261 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PPCSQ9HAB8 311 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GALNT9Q9HCQ5 603 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CHST11Q9NPF2 352 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 COQ3Q9NZJ6 369 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SLC17A7Q9P2U7 560 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ACAD8Q9UKU7 415 aa12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 MPDZO75970 2070 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SERTM1A2A2V5 107 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CAPN14A8MX76 684 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TMEM233B4DJY2 109 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 UGT2B11O75310 529 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PPM1BO75688 479 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 JUNP05412 331 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CHRNGP07510 517 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CREB1P16220 341 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TACR1P25103 407 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ACVR2AP27037 513 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 IFFO1Q0D2I5 559 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 HEPACAMQ14CZ8 416 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TMEM198Q66K66 360 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GALNT18Q6P9A2 607 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 NPSR1Q6W5P4 371 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 FAM9CQ8IZT9 166 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 BANPQ8N9N5 519 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C17orf47Q8NEP4 570 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 OR7G2Q8NG99 324 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 OR2T11Q8NH01 316 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ZNF675Q8TD23 568 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 HGDQ93099 445 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 EGLN2Q96KS0 407 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 GNRHR2Q96P88 292 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ANGPTL4Q9BY76 406 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 METTL7AQ9H8H3 244 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SENP1Q9P0U3 644 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CFL2Q9Y281 166 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SLC6A5Q9Y345 797 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 CCL27Q9Y4X3 112 aa12.67□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PDZD2O15018 2839 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 OR14I1A6ND48 311 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 FIGNL2A6NMB9 653 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 C17orf51A8MQB3 221 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 BCKDKO14874 412 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 AZIN1O14977 448 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 SUSD5O60279 629 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC6AO75865 159 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 NUDT17P0C025 328 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 UROSP10746 265 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 DDCP20711 480 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 ALDH3A1P30838 453 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 PTGDSP41222 190 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 WNT3P56703 355 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-209ENST00000439106 TOMM20Q15388 145 aa12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms