RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 BBS10Q8TAM1 723 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ADAMTS15Q8TE58 950 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SLC38A5Q8WUX1 472 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PROX1Q92786 737 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 KAT2AQ92830 837 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RAB8BQ92930 207 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NAT6Q93015 286 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TMBIM1Q969X1 311 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TAMM41Q96BW9 452 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM19Q96HH6 336 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 MS4A4EQ96PG1 132 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SLC29A1Q99808 456 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ACTRT3Q9BYD9 372 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 REEP1Q9H902 201 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NTN4Q9HB63 628 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CAPN10Q9HC96 672 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 EXD2Q9NVH0 621 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CALML5Q9NZT1 146 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 NTMQ9P121 344 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SEMA5BQ9P283 1151 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF639Q9UID6 485 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 SERTAD3Q9UJW9 196 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 LIPT1Q9Y234 373 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.22□□□□□ -1.41
HDAC8-211ENST00000415409 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 A0A087WV62 115 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 A0A1W2PS29 197 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C7orf72A4D263 438 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 A8MU76 341 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FAM227AF5H4B4 570 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 hCG_2039718K7EN88 272 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 UPK1AO00322 258 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ADAMDEC1O15204 470 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 FOXS1O43638 330 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PLOD3O60568 738 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CTNSO60931 367 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 LDB3O75112 727 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SOX30O94993 753 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CPNE6O95741 557 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ALBP02768 609 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OPN1SWP03999 348 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CTSBP07858 339 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MSL3P1P0C860 447 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SP9P0CG40 484 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MYF5P13349 255 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ETS2P15036 469 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 NELFEP18615 380 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 PTGER1P34995 402 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ARSFP54793 590 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ITGA1P56199 1179 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 HSD17B7P56937 341 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KCNJ10P78508 379 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DAB2P98082 770 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ID2Q02363 134 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ACY1Q03154 408 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CFHR1Q03591 330 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EPS8Q12929 822 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC13A2Q13183 592 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 RFX4Q33E94 735 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GPAT3Q53EU6 434 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZNF628Q5EBL2 1059 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 KRT80Q6KB66 452 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CDC73Q6P1J9 531 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 GUSBP11Q6P575 273 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 C16orf62Q7Z3J2 963 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 STK32CQ86UX6 486 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 CYP4Z1Q86W10 505 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 OR2L13Q8N349 312 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 MARVELD2Q8N4S9 558 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.21□□□□□ -1.42
HDAC8-211ENST00000415409 EID2Q8N6I1 236 aa6.21□□□□□ -1.42
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