RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 NEURL3Q96EH8 262 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 C16orf58Q96GQ5 468 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ANKRD27Q96NW4 1050 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SERHL2Q9H4I8 314 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 FOLH1BQ9HBA9 442 aa26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ARGFXA6NJG6 315 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 B2RBV5 119 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 UNC5CO95185 931 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ITPKBP27987 946 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A3Q00325 362 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 BNIP1Q12981 228 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CHAF1BQ13112 559 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RUNDC3AQ59EK9 446 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 DCAF10Q5QP82 559 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MFSD12Q6NUT3 480 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 HACD2Q6Y1H2 254 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PROSER1Q86XN7 944 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 GAL3ST4Q96RP7 486 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ITPAQ9BY32 194 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa26.19■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CLIC1O00299 241 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CLCN2P51788 898 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MNAT1P51948 309 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RABL3Q5HYI8 236 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 COX20Q5RI15 118 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC81Q6ZN84 652 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 M1APQ8TC57 530 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ELP5Q8TE02 316 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 THAP4Q8WY91 577 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 JADE3Q92613 823 aa26.18■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ITGAMP11215 1152 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 EBPQ15125 230 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 NNATQ16517 81 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 NANOGP8Q6NSW7 305 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 BHLHB9Q6PI77 547 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 HSDL2Q6YN16 418 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 VSTM2LQ96N03 204 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 NANOGQ9H9S0 305 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MMP25Q9NPA2 562 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 POLHQ9Y253 713 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 KRT75O95678 551 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 NPPAP01160 153 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 KRT16P08779 473 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ACP2P11117 423 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MVDP53602 400 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 RNF4P78317 190 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 BROXQ5VW32 411 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CCDC121Q6ZUS5 278 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC29A4Q7RTT9 530 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 C10orf111Q8N326 155 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR5D16Q8NGK9 328 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 WWTR1Q9GZV5 400 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CPNE5Q9HCH3 593 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PRODH2Q9UF12 536 aa26.17■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 EXPH5Q8NEV8 1989 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR6C76A6NM76 312 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC6A2P23975 617 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CPOXP36551 454 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CORO7P57737 925 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PSME3P61289 254 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 DEFB109BQ30KR1 87 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 GPR155Q7Z3F1 870 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC9A6Q92581 669 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SERPINA7P05543 415 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MATN1P21941 496 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 PRIM2P49643 509 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 NPSR1Q6W5P4 371 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 KBTBD2Q8IY47 623 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 HORMAD2Q8N7B1 307 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ACTRT3Q9BYD9 372 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 DEFB126Q9BYW3 111 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR51I1Q9H343 314 aa26.15■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 ETFAP13804 333 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CRATP43155 626 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC7A2P52569 658 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 MYBPC3Q14896 1274 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 CLEC1AQ8NC01 280 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 SLC16A11Q8NCK7 471 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR8J3Q8NGG0 315 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR52N2Q8NGI0 321 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM125Q96AQ2 219 aa26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
GIPC1-202ENST00000393028 OR7D2Q96RA2 312 aa26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms