RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364005.1

RNU6-340P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 340, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-340P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-340P-201ENST00000364005 UBL4AP11441 157 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 BTDP43251 543 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CNTN2Q02246 1040 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CACNG1Q06432 222 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ENPEPQ07075 957 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 NSDHLQ15738 373 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZIC1Q15915 447 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 BAK1Q16611 211 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF181Q2M3W8 571 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 UNC50Q53HI1 259 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RABGAP1LQ5R372 815 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SEL1L2Q5TEA6 688 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SHEQ5VZ18 495 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF730Q6ZMV8 503 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRUNE1Q86TP1 453 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 GID4Q8IVV7 300 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RDH10Q8IZV5 341 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 FAM86B1Q8N7N1 296 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CCDC63Q8NA47 563 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF740Q8NDX6 193 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 C8orf46Q8TAG6 207 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 FGGYQ96C11 551 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PGM2Q96G03 612 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 MS4A10Q96PG2 267 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RASL11BQ9BPW5 248 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 FAM129AQ9BZQ8 928 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TRIM9Q9C026 710 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ALG9Q9H6U8 611 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CDH20Q9HBT6 801 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SH2D2AQ9NP31 389 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 GDF3Q9NR23 364 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 MBD2Q9UBB5 411 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF222Q9UK12 451 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TNXBP22105 4242 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 A0A1W2PPQ1 181 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF320A2RRD8 509 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 K7ERI5 159 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SULT2B1O00204 365 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 P2RX6O15547 441 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR10H3O60404 316 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TMEM63AO94886 807 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 GSRP00390 522 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 LYNP07948 512 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PSMC3P17980 439 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 IGFBP5P24593 272 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRPS1P60891 318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RPL32P62910 135 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CXCL9Q07325 125 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SMARCB1Q12824 385 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 BECN1Q14457 450 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 DEFB134Q4QY38 66 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF542PQ5EBM4 170 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PRR27Q6MZM9 219 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 UFSP1Q6NVU6 142 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SPINT4Q6UDR6 99 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 GVQW1Q8N7I0 195 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CCNYQ8ND76 341 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF680Q8NEM1 530 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 OR4F5Q8NH21 305 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 FAM151AQ8WW52 585 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 USP6NLQ92738 828 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RNF125Q96EQ8 232 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RNF157Q96PX1 679 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 PKMYT1Q99640 499 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TRIM7Q9C029 511 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 MMP27Q9H306 513 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 EQTNQ9NQ60 294 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TBC1D22BQ9NU19 505 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 MED17Q9NVC6 651 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 RNF150Q9ULK6 438 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TBX20Q9UMR3 447 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 WDR45Q9Y484 360 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 KCNE2Q9Y6J6 123 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 LAMB4A4D0S4 1761 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 TNCP24821 2201 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 LRRC72A6NJI9 287 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 E5RGE8 158 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-340P-201ENST00000364005 CCDC188H7C350 402 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms