RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ATP8B1O43520 1251 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 RGS14O43566 566 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 LRATO95237 230 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 IGHG3P01860 377 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FGF4P08620 206 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 IL3P08700 152 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CREB1P16220 341 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 GPX3P22352 226 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HTR1EP28566 365 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 GRNP28799 593 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ALDH3A1P30838 453 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 PIGAP37287 484 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FEN1P39748 380 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ETV4P43268 484 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FOXA1P55317 472 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NRG3P56975 720 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HMGCS1Q01581 520 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP2Q05923 314 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FOXO1Q12778 655 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 RPS6KA2Q15349 733 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NTRK2Q16620 822 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A10Q63ZE4 541 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 XKRXQ6PP77 449 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 PAOXQ6QHF9 649 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM64Q6YI46 380 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CLYBLQ8N0X4 340 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FAM109AQ8N4B1 249 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf47Q8NEP4 570 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 OR5M3Q8NGP4 307 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FAM76AQ8TAV0 307 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CHTF18Q8WVB6 975 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TP53INP1Q96A56 240 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TLCD1Q96CP7 247 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 MAT2BQ9NZL9 334 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CNIH4Q9P003 139 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HEY2Q9UBP5 337 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 UTS2RQ9UKP6 389 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 PSME2Q9UL46 239 aa7.05□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TMED5Q9Y3A6 229 aa7.05□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.05□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 UQCRHLA0A096LP55 91 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 OR14I1A6ND48 311 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CAPN14A8MX76 684 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 SLC28A1O00337 649 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TP53I11O14683 189 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6AP2O75787 350 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN14O95500 239 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA4LO95757 839 aa7.04□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 S1PR1P21453 382 aa7.04□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 MAPK1P28482 360 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 FBXW4P57775 412 aa7.04□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF763Q0D2J5 394 aa7.04□□□□□ -1.28
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SGMS1-201ENST00000361543 MAP4K2Q12851 820 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 DUSP8Q13202 625 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 LTB4RQ15722 352 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 NNATQ16517 81 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 EMC4Q5J8M3 183 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 SPDYAQ5MJ70 313 aa7.04□□□□□ -1.28
SGMS1-201ENST00000361543 TBCELQ5QJ74 424 aa7.04□□□□□ -1.28
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