RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 SOD2P04179 222 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PAX6P26367 422 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DEFA5Q01523 94 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GALEQ14376 348 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ELOA3BQ3SY89 546 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 UBXN11Q5T124 520 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD54Q6NXT1 300 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ELOA3Q8NG57 546 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR10H4Q8NGA5 316 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 HIPK2Q9H2X6 1198 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FBXL3Q9UKT7 428 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SARDHQ9UL12 918 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FZD4Q9ULV1 537 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD61A6NGH8 418 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 H7BY64 318 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 KDELR3O43731 214 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 PGLSO95336 258 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GBAP04062 536 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FABP1P07148 127 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ADRB2P07550 413 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GIPP09681 153 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF81P51508 661 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 KCT2Q8NC54 265 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR52N2Q8NGI0 321 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 FANK1Q8TC84 345 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 STK35Q8TDR2 534 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 RNF141Q8WVD5 230 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NACC2Q96BF6 587 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SLC39A13Q96H72 371 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NTMT1Q9BV86 223 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TREM1Q9NP99 234 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM212A6NML5 194 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GPR149Q86SP6 731 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR4K1Q8NGD4 311 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 OR56A3Q8NH54 315 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 ZFPM2Q8WW38 1151 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TM9SF4Q92544 642 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 GLYATL1Q969I3 302 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 DPEP3Q9H4B8 488 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 SFXN1Q9H9B4 322 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 RLIMQ9NVW2 624 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CLDND1Q9NY35 253 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 CACNG2Q9Y698 323 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRD-201ENST00000355233 EMC8O43402 210 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 ORAI3Q9BRQ5 295 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRD-201ENST00000355233 EPHX3Q9H6B9 360 aa4.69□□□□□ -1.66
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