RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD6Q96NE9 622 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OR2A14Q96R47 310 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 OLFM1Q99784 485 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MECRQ9BV79 373 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 VN1R1Q9GZP7 353 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 PLLPQ9Y342 182 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 BMP7P18075 431 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC7A2P52569 658 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R41P59536 307 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 CASP12Q6UXS9 341 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 CARFQ8N187 725 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 SSC4DQ8WTU2 575 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 FIG4Q92562 907 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 EID2BQ96D98 161 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRC-201ENST00000348564 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.15□□□□□ -1.74
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PTPRC-201ENST00000348564 HPP00738 406 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A25Q6T423 547 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 PM20D2Q8IYS1 436 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 COL21A1Q96P44 957 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
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PTPRC-201ENST00000348564 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRC-201ENST00000348564 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
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