RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299022.9

LIPC-201, Transcript of lipase C, hepatic type, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIPC, Length 2,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPC-201ENST00000299022 CASP12Q6UXS9 341 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OR9A2Q8NGT5 310 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 LRR1Q96L50 414 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ARPC5LQ9BPX5 153 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CDCA4Q9BXL8 241 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 NUAK2Q9H093 628 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SLC25A19Q9HC21 320 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MAN2B1O00754 1011 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SNPHO15079 494 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 FCMRO60667 390 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 GUCY1B2O75343 617 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 AIFM1O95831 613 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CHRNB1P11230 501 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 S100A5P33763 92 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 UGT2B10P36537 528 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ETV5P41161 510 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 AVPR1BP47901 424 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ETV1P50549 477 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CAV3P56539 151 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 COPZ1P61923 177 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TUBA1BP68363 451 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 GINS1Q14691 196 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 PDGFRLQ15198 375 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TUBA1AQ71U36 451 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 KIF18BQ86Y91 864 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TBC1D19Q8N5T2 526 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SYT14Q8NB59 555 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OR4E2Q8NGC2 313 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CLIP3Q96DZ5 547 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 PELI2Q9HAT8 420 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 NEK6Q9HC98 313 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.3□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SEMA3DO95025 777 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ADAP00813 363 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CXCR2P25025 360 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ID2Q02363 134 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TFF2Q03403 129 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CHRNEQ04844 493 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ILKQ13418 452 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 INSL4Q14641 139 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SPHARQ15513 63 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ZNF181Q2M3W8 571 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 PPP2R2DQ66LE6 453 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 LAX1Q8IWV1 398 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 UBE2J2Q8N2K1 259 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 FRMD1Q8N878 549 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 KBTBD8Q8NFY9 601 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 GPR151Q8TDV0 419 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TAPBPLQ9BX59 468 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ASPNQ9BXN1 380 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 HDAC8Q9BY41 377 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SAGE2PA6NJ88 616 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 BTN3A3O00478 584 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CEACAM5P06731 702 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 PBX2P40425 430 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 CASP3P42574 277 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 RAB28P51157 221 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OLR1P78380 273 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 RPA4Q13156 261 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 RUNX3Q13761 415 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TUBA3EQ6PEY2 450 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 PRR23CQ6ZRP0 262 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 GDPD3Q7L5L3 318 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SFTPA2Q8IWL1 248 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 OR8D4Q8NGM9 314 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 SLC9A6Q92581 669 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 ZNF607Q96SK3 696 aa9.29□□□□□ -0.92
LIPC-201ENST00000299022 TEX101Q9BY14 249 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms