RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000269740.8

SLC39A3-201, Transcript of solute carrier family 39 member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC39A3, Length 1,502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3-201ENST00000269740 CALB2P22676 271 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 PPIBP23284 216 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ITPKBP27987 946 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MAGEA8P43361 318 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TP53BP2Q13625 1128 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 SZRD1Q7Z422 152 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 NUBPLQ8TB37 319 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 LRRC58Q96CX6 371 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 GIMAP5Q96F15 307 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CGREF1Q99674 301 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 DEFB126Q9BYW3 111 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ARGFXA6NJG6 315 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 PRIM2P49643 509 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 DCAF7P61962 342 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CHAF1BQ13112 559 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ART3Q13508 389 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MSRB3Q8IXL7 192 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 C9orf40Q8IXQ3 194 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CDRT4Q8N9R6 151 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 C17orf47Q8NEP4 570 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 VSTM2LQ96N03 204 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ANKRD27Q96NW4 1050 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ING2Q9H160 280 aa22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CLIC1O00299 241 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 KRT16P08779 473 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 T-ENOLP0DO92 83 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 NUDT2P50583 147 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EBPQ15125 230 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 GTDC1Q4AE62 458 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ARMC10Q8N2F6 343 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 KIF2BQ8N4N8 673 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MIPOL1Q8TD10 442 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 FXYD1O00168 92 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 UBOX5O94941 541 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CELA2AP08217 269 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ITGAMP11215 1152 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 PPICP45877 212 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 DEFB109BQ30KR1 87 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 RUNDC3AQ59EK9 446 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 TP53INP1Q96A56 240 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 SH3GL1Q99961 368 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ACTRT3Q9BYD9 372 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 WWTR1Q9GZV5 400 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 LHPPQ9H008 270 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 FOLH1BQ9HBA9 442 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CPNE5Q9HCH3 593 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 GIN1Q9NXP7 522 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CORO2BQ9UQ03 480 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 KCNMB2Q9Y691 235 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EVPLLA8MZ36 301 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MASP2O00187 686 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EBAG9O00559 213 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 DRD5P21918 477 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 MAP3K8P41279 467 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CPA2P48052 419 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 PSPHP78330 225 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 GALNT16Q8N428 558 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 AMER2Q8N7J2 671 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ADIPOR1Q96A54 375 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC35G5Q96KT7 338 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 EQTNQ9NQ60 294 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 NDE1Q9NXR1 346 aa22.11■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 DUXAA6NLW8 204 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 UNC5CO95185 931 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ITGA3P26006 1051 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 CDC73Q6P1J9 531 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa22.1■■□□□ 1.13
SLC39A3-201ENST00000269740 SLC5A8Q8N695 610 aa22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms