RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 AVPR2P30518 371 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CCL11P51671 97 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TAP2Q03519 686 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SRYQ05066 204 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TCTN1Q2MV58 587 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SFT2D3Q587I9 215 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DENND5AQ6IQ26 1287 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 METTL4Q8N3J2 472 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KCNE4Q8WWG9 221 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CBLCQ9ULV8 474 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SPEF1Q9Y4P9 236 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 A0A1W2PPL8 197 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HAT1O14929 419 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MT-CO3P00414 261 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CTSLP07711 333 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ADGRE1Q14246 886 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IQCCQ4KMZ1 466 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR52R1Q8NGF1 315 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CTRCQ99895 268 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BTBD2Q9BX70 525 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GSTO2Q9H4Y5 243 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BAIAP2Q9UQB8 552 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UNC119BA6NIH7 251 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 SLC30A4O14863 429 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR2T1O43869 369 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CSF2P04141 144 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FAM180AQ6UWF9 173 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZSWIM9Q86XI8 627 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 UEVLDQ8IX04 471 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR8H2Q8N162 312 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 KLHL36Q8N4N3 616 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TSPAN14Q8NG11 270 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ATOH8Q96SQ7 321 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PRO3102Q9H379 93 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 EHD3Q9NZN3 535 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GIMAP2Q9UG22 337 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RAB26Q9ULW5 256 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 POMPQ9Y244 141 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.55□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 G3V2L1 256 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TGFBR3Q03167 851 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CIB1Q99828 191 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HDHD5Q9BXW7 423 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 LYRM4Q9HD34 91 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CTNSO60931 367 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ANGPTL1O95841 491 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MNDAP41218 407 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MC3RP41968 323 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GK3PQ14409 553 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PDK3Q15120 406 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 GPR19Q15760 415 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 IER5LQ5T953 404 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CARFQ8N187 725 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ANKFN1Q8N957 763 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 RELTQ969Z4 430 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ANTXRLA6NF34 631 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 K7ESM1 405 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 CITO14578 2027 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 TBX1O43435 398 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ADORA3P0DMS8 318 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 HSD17B7P56937 341 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NXPH1P58417 271 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 VLDLRP98155 873 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 FOLH1Q04609 750 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ACVR1Q04771 509 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 MALLQ13021 153 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 PPP1R3AQ16821 1122 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 NANOGP8Q6NSW7 305 aa7.54□□□□□ -1.2
NANOG-201ENST00000229307 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms