RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 B3GNT7Q8NFL0 401 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2L5Q8NG80 312 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR8J1Q8NGP2 316 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CREB3L4Q8TEY5 395 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PRRC1Q96M27 445 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 AMDHD1Q96NU7 426 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C17orf62Q9BQA9 187 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DPH7Q9BTV6 452 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LGR4Q9BXB1 951 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX12Q9BXU0 123 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MROQ9BYG7 248 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR51I1Q9H343 314 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DSN1Q9H410 356 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf14Q9HBI5 128 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLAMF7Q9NQ25 335 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RLIMQ9NVW2 624 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MS4A12Q9NXJ0 267 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR83Q9NYM4 423 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CFL2Q9Y281 166 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR1A2Q9Y585 309 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX16Q9Y5Y5 336 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.69□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PRQ8 180 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GSAPA4D1B5 854 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LRIT2A6NDA9 550 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BN98 237 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TGFBR3LH3BV60 316 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 J3KTA2 159 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CCRL2O00421 344 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SYT5O00445 386 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ERI3O43414 337 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 POU1F1P28069 291 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 BCL6P41182 706 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 BCAP31P51572 246 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 NUDT6P53370 316 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MLLT10P55197 1068 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA1024LP59773 190 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RHAGQ02094 409 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ILKQ13418 452 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF181Q2M3W8 571 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ATAD3BQ5T9A4 648 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RNLSQ5VYX0 342 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAG1Q6DJT9 500 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TANGO2Q6ICL3 276 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CACUL1Q86Y37 369 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC103Q8IW40 242 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD4AQ8N468 514 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR52E1Q8NGJ3 308 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2A1Q8NGT9 310 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ASB12Q8WXK4 309 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 OR2M4Q96R27 311 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SARGQ9BW04 601 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 MND1Q9BWT6 205 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 PINK1Q9BXM7 581 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 BTBD1Q9H0C5 482 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD19PQ9H560 264 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa8.68□□□□□ -1.02
EFTUD2-222ENST00000592408 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms